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筛选凝聚物相关特异性的方法及其用途与流程

作者:admin      2022-07-10 20:41:01     500



测量装置的制造及其应用技术筛选凝聚物相关特异性的方法及其用途1.相关申请的交叉引用2.本技术要求2019年9月18日提交的美国临时申请号62/902,316的优先权权益,该美国临时申请的内容以引用方式全文并入本文。技术领域3.本发明涉及生物凝聚物的领域。背景技术:4.细胞含有膜结合的细胞器,诸如线粒体、溶酶体和内质网,以部分定位各种细胞功能。除了膜结合的细胞器外,细胞还含有不同的子隔室,所述子隔室不包括在其与其紧邻周围溶液之间的膜。这些无膜分子组件中的许多已被证明是以类似于油滴在水中的分配的方式,通过称为液-液相分离或冷凝的过程形成的。在这种过程期间,例如,包含生物大分子的溶液分离成不同的相,即富含所述生物大分子中的至少一些生物大分子的凝聚物稠密相和周围的轻相。已认识到许多细胞凝聚物在生物学中发挥重要作用(banani等人,2017,nat rev mol cell biol,18:285-298)。5.已知各种凝聚物对于调节不同细胞类型中的特定细胞过程很重要。机械地,例如,凝聚物可以将分子以高浓度聚集在一起以加速凝聚物内的反应,或者可以隔离凝聚物中的分子,从而降低它们在周围介质中的的浓度并阻止它们在周围介质中的活性。异常的凝聚物功能还已经与各种人类疾病,诸如神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫疾病、心脏疾病或代谢疾病有关(naumann等人,2018,nat commun,9(1):335;wegmann等人,2018,embo j,37(7):e98049;和aguzzi等人,2016,26(7):547-558)。然而,对控制单个大分子分配进或出凝聚物的机制缺乏了解,并且对于化合物是否可以选择性地改变单个大分子分配进或出凝聚物的知之甚少或一无所知。6.包括专利申请和出版物在内的本文引用的所有参考文献以引用方式以其整体并入本文。技术实现要素:7.本文提供了鉴定优先影响第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含所述一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;以及(b)确定所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平以及至少一种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平,其中如果所述化合物导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第一参考水平发生的改变多于所述化合物导致每种附加大分子的所述水平相较于每种附加大分子的参考水平发生的改变,则所述化合物优先影响所述第一大分子的所述水平。在一些实施方案中,所述化合物不导致每种附加大分子的所述水平相较于每种附加大分子的参考水平发生可测量地改变。8.本文还提供了鉴定优先增大第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含所述一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;以及(b)确定所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平以及至少一种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平,其中如果所述化合物导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第一参考水平发生的增大多于所述化合物导致每种附加大分子的所述水平相较于每种附加大分子的参考水平发生的增大,则所述化合物优先增大所述第一大分子的所述水平。在一些实施方案中,所述化合物不导致每种附加大分子的所述水平与每种附加大分子的参考水平相比发生可测量地增大。9.本文还提供了鉴定优先降低第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含所述一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;以及(b)确定所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平以及至少一种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平,其中如果所述化合物导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第一参考水平发生的改变多于所述化合物导致每种附加大分子的所述水平相较于每种附加大分子的参考水平发生的改变,则所述化合物优先降低所述第一大分子的所述水平。在一些实施方案中,所述化合物不导致每种附加大分子的所述水平相较于每种附加大分子的参考水平发生会可测量地降低。10.在一些实施方案中,第一参考水平是在不存在所述化合物的情况确定的第一大分子与一种或多种参考凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,每种附加大分子的参考水平是在不存在所述化合物的情况下确定的每种附加大分子与一种或多种参考凝聚物的缔合水平。11.本文还提供了鉴定优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合的化合物的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含所述一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;以及(b)确定第一大分子和至少一种附加大分子是否与所述一种或多种靶凝聚物缔合,其中如果出现以下情况,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合:(1)所述化合物导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合;(2)所述化合物不导致每种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合;以及(3)所述第一大分子在不存在所述化合物的情况下将不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。12.在一些实施方案中,如果(4)所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将不与所述一种或多种靶凝聚物缔合,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,如果(4)所述至少一种附加大分子中的每种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将不与所述一种或多种靶凝聚物缔合,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。13.本文还提供了鉴定优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物解除缔合的化合物的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含所述一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;以及(b)确定第一大分子和至少一种附加大分子是否与所述一种或多种靶凝聚物缔合,其中如果出现以下情况,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物解除缔合:(1)所述化合物导致所述第一大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合;(2)所述化合物不导致每种附加大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合;以及(3)所述第一大分子在不存在所述化合物的情况下将与所述一种或多种靶凝聚物缔合。14.在一些实施方案中,如果(4)所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将与所述一种或多种靶凝聚物缔合,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,如果(4)所述至少一种附加大分子中的每种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将与所述一种或多种靶凝聚物缔合,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。15.在一些实施方案中,步骤(a)包括使细胞组合物与化合物接触,其中所述细胞组合物包含所述一种或多种靶凝聚物,并且所述方法进一步包括使所述一种或多种靶凝聚物在步骤(a)之前形成。在一些实施方案中,步骤(a)包括使细胞组合物与化合物接触,其中所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触之后形成的,并且所述方法进一步包括使所述一种或多种靶凝聚物形成。16.在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子是2种或更多种、3种或更多种、4种或更多种,或5种或更多种大分子。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子是1至10种大分子。17.在一些实施方案中,第一大分子在疾病状态下异常表达。在一些实施方案中,所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的疾病状态缔合水平相较于所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的正常状态缔合水平发生改变。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子在疾病状态下异常表达。18.在一些实施方案中,第一大分子是dna或rna。在一些实施方案中,第一大分子是蛋白质。在一些实施方案中,第一大分子包含这样的突变,所述突变导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平与不包含所述突变的相关蛋白质相比发生改变。在一些实施方案中,第一大分子是fus或eif3。19.在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子是dna或rna。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子是蛋白质。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子包含这样的突变,所述突变导致所述至少一种附加大分子中的所述一种或多种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的相应缔合水平与不包含所述突变的相关蛋白质相比发生改变。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子是fus、eif3、g3bp1、fus和g3bp1,或eif3和g3bp1。20.在一些实施方案中,所述第一大分子和/或所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子是融合蛋白。在一些实施方案中,所述第一大分子和/或所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子包含标记物。在一些实施方案中,所述方法进一步包括标记所述第一大分子和/或所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子。在一些实施方案中,所述标记包括使细胞组合物与包含标记物的抗体或其抗原缔合片段接触。在一些实施方案中,所述标记物是放射性标记物、比色标记物,或荧光标记物。21.在一些实施方案中,所述细胞组合物包含微生物或动物细胞。在一些实施方案中,所述细胞组合物包含动物细胞。在一些实施方案中,所述动物细胞具有神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫性疾病、心脏疾病或代谢疾病的一种或多种特征。在一些实施方案中,所述动物细胞是hela细胞、hek293细胞、诱导多能干细胞(ipsc细胞)、心肌细胞、肌细胞、干细胞衍生细胞、神经元、癌细胞、免疫细胞,或脂肪细胞。22.在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物是细胞凝聚物。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物是细胞核凝聚物或细胞质凝聚物。在一些实施方案中,所述细胞凝聚物是裂解体、p颗粒、组蛋白基因座体、多泡体、神经元rna颗粒、核凝胶珠(nuclear gem)、核孔、核小点、核应激小体、核仁、oct1/ptf/转录(opt)结构域、旁斑、核仁外周区室、pml核体、pml致癌结构域、多梳体、处理体、sam68核体、应激颗粒,或剪接斑点。23.在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物是单一靶凝聚物。在一些实施方案中,所述化合物不导致以下中的一者或多者发生可测量地改变:靶凝聚物的大小、靶凝聚物的位置、靶凝聚物的表面积,和靶凝聚物的溶解。24.在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物是复数种靶凝聚物。在一些实施方案中,所述化合物不导致以下中的一者或多者发生可测量地改变:所述复数种靶凝聚物的总数目;所述复数种靶凝聚物的大小、所述复数种靶凝聚物的位置、所述复数种靶凝聚物的表面积,和所述复数种靶凝聚物的溶解。25.在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物是复数种靶凝聚物。在一些实施方案中,所述复数种靶凝聚物是细胞组合物的一部分中的一类凝聚物的全部或子集。在一些实施方案中,所述复数种靶凝聚物是细胞组合物中的细胞中的一类凝聚物的全部或子集。在一些实施方案中,所述复数种靶凝聚物是细胞组合物中的细胞的一部分中的一类凝聚物的全部或子集。在一些实施方案中,所述细胞的所述部分是细胞质、细胞核,或细胞器。26.在一些实施方案中,所述的一类凝聚物包括包含特定大分子的凝聚物。在一些实施方案中,所述的一类凝聚物包括作为裂解体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为p颗粒的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为组蛋白基因座体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为多泡体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为神经元rna颗粒的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核凝胶珠的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核孔的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核小点的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核应激小体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核仁的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为oct1/ptf/转录(opt)结构域的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为旁斑(paraspeckle)的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核仁外周区室的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为pml核体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为pml致癌结构域的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为多梳体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为处理体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为sam68核体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为应激颗粒的凝聚物;或其中所述的一类凝聚物包括作为剪接斑点的凝聚物。27.本文还提供了鉴定优先影响、降低或增大第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平,或者优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的复数种化合物的方法,所述方法包括利用复数种化合物执行鉴定本文所公开的化合物的方法。28.在一些实施方案中,所述方法进一步包括鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响、降低或增大第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力,或者优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的能力之外还共同具有的特征。在一些实施方案中,所述方法进一步包括对一种或多种包含所鉴定出的特征的附加测试化合物执行鉴定本文所公开的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法进一步包括对一种或多种不包含所鉴定出的特征的附加测试化合物执行鉴定本文所公开的化合物的方法。29.本文还提供了鉴定与优先影响、降低或增大第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平相关联或者与优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合相关联的化合物特征的方法,所述方法包括:(a)执行鉴定本文所公开的复数种化合物的方法;以及(b)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响、降低或增大第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力,或者优先导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的能力之外还共同具有的特征。30.本文还提供了设计优先影响、降低或增大第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平,或者优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的化合物的方法,所述方法包括:(a)执行鉴定本文所公开的复数种化合物的方法;(b)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响、降低或增大第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力,或者优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的能力之外还共同具有的特征;以及(c)设计包含所鉴定出的特征的化合物,从而设计优先影响、降低或增大第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平,或者优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的化合物。31.本文还提供了鉴定可用于治疗有需要的个体的疾病的化合物的方法,所述方法包括:执行鉴定本文所公开的化合物的方法,其中一种或多种靶凝聚物与所述疾病相关联;以及鉴定优先影响、降低或增大第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平或者优先导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合从而对治疗所述疾病有用的化合物。在一些实施方案中,所述疾病是神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫性疾病、心脏疾病或代谢疾病。32.本文还提供了鉴定优先影响第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法,所述方法包括:用第一组的一种或多种靶凝聚物执行鉴定本文所公开的化合物的方法;以及用第二组的一种或多种靶凝聚物执行鉴定本文所公开的化合物的方法,其中如果化合物对第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的优先影响多于所述化合物对第一大分子与第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的优先影响,则所述化合物优先影响第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,所述化合物不影响第一大分子与第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。33.本文还提供了鉴定优先增大第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法,所述方法包括:用第一组的一种或多种靶凝聚物执行鉴定本文所公开的化合物的方法;以及用第二组的一种或多种靶凝聚物执行鉴定本文所公开的化合物的方法,其中如果化合物对第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的优先增大多于所述化合物对第一大分子与第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的优先增大,则所述化合物优先增大第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,所述化合物不增大第一大分子与第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。34.本文还提供了鉴定优先降低第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法,所述方法包括:用第一组的一种或多种靶凝聚物执行鉴定本文所公开的化合物的方法;以及用第二组的一种或多种靶凝聚物执行鉴定本文所公开的化合物的方法,其中如果化合物对第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的优先降低多于所述化合物对第一大分子与第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的优先降低,则所述化合物优先降低第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,所述化合物不降低第一大分子与第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。35.本文还提供了鉴定优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合的化合物的方法,所述方法包括:用第一组的一种或多种靶凝聚物执行鉴定本文所公开的化合物的方法;以及用第二组的一种或多种靶凝聚物执行鉴定本文所公开的化合物的方法,其中如果化合物优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合的程度多于所述化合物优先导致第一大分子与第二组的一种或多种靶凝聚物缔合的程度,则所述化合物优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合。36.本文还提供了鉴定优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物解除缔合的化合物的方法,所述方法包括:用第一组的一种或多种靶凝聚物执行鉴定本文所公开的化合物的方法;以及用第二组的一种或多种靶凝聚物执行鉴定本文所公开的化合物的方法,其中如果化合物优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合的程度多于所述化合物优先导致第一大分子与第二组的一种或多种靶凝聚物缔合的程度,则所述化合物优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物解除缔合。37.在一些实施方案中,所述第一和/或第二组的一种或多种靶凝聚物是细胞凝聚物。在一些实施方案中,所述第一和/或第二组的一种或多种靶凝聚物是细胞核凝聚物或细胞质凝聚物。38.在一些实施方案中,所述第一和/或第二组的一种或多种靶凝聚物是裂解体、p颗粒、组蛋白基因座体、多泡体、神经元rna颗粒、核凝胶珠、核孔、核小点、核应激小体、核仁、oct1/ptf/转录(opt)结构域、旁斑、核仁外周区室、pml核体、pml致癌结构域、多梳体、处理体、sam68核体、应激颗粒,或剪接斑点。39.在一些实施方案中,所述第一和/或第二组的一种或多种靶凝聚物是单一靶凝聚物。40.在一些实施方案中,所述第一和/或第二组的一种或多种靶凝聚物是复数种靶凝聚物。在一些实施方案中,所述第一和/或第二组的一种或多种靶凝聚物是细胞组合物的一部分中的一类凝聚物的全部或子集。在一些实施方案中,所述第一和/或第二组的一种或多种靶凝聚物是细胞组合物中的细胞中的一类凝聚物的全部或子集。在一些实施方案中,所述第一和/或第二组的一种或多种靶凝聚物是细胞组合物中的细胞的一部分中的一类凝聚物的全部或子集。在一些实施方案中,所述细胞的所述部分是细胞质、细胞核,或细胞器。41.在一些实施方案中,所述的一类凝聚物包括包含特定大分子的凝聚物。在一些实施方案中,所述的一类凝聚物包括作为裂解体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为p颗粒的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为组蛋白基因座体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为多泡体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为神经元rna颗粒的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核凝胶珠的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核孔的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核小点的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核应激小体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核仁的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为oct1/ptf/转录(opt)结构域的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为旁斑(paraspeckle)的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核仁外周区室的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为pml核体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为pml致癌结构域的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为多梳体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为处理体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为sam68核体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为应激颗粒的凝聚物;或其中所述的一类凝聚物包括作为剪接斑点的凝聚物。42.在一些实施方案中,第一组的一种或多种靶凝聚物的类别与第二组的一种或多种靶凝聚物的类别相同。在一些实施方案中,第一组的一种或多种靶凝聚物的类别与第二组的一种或多种靶凝聚物的类别不同。43.在一些实施方案中,第一组的一种或多种靶凝聚物与第二组的一种或多种靶凝聚物在同一细胞组合物中。在一些实施方案中,细胞组合物包含细胞,所述细胞包含第一组的一种或多种靶凝聚物和第二组的一种或多种靶凝聚物。在一些实施方案中,第一组的一种或多种靶凝聚物在第一细胞组合物中,而第二组的一种或多种靶凝聚物在第二细胞组合物中。44.在一些实施方案中,第一组的一种或多种靶凝聚物在细胞组合物中的细胞中,并且所述细胞具有疾病的一种或多种特征。在一些实施方案中,所述疾病是神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫性疾病、心脏疾病或代谢疾病。45.本文还提供了鉴定优先影响、降低或增大第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平,或优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的复数种化合物的方法,所述方法包括用复数种化合物执行鉴定本文所公开的化合物的方法。46.在一些实施方案中,所述方法进一步包括鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响、降低或增大第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力,或者优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的能力之外还共同具有的特征。47.在一些实施方案中,所述方法进一步包括对一种或多种包含所鉴定出的特征的附加测试化合物执行鉴定本文所公开的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法进一步包括对一种或多种不包含所鉴定出的特征的附加测试化合物执行鉴定本文所公开的化合物的方法。48.本文还提供了鉴定与优先影响、降低或增大第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平相关联或者与优选导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合相关联的化合物特征的方法,所述方法包括:(a)执行鉴定本文所公开的复数种化合物的方法;以及(b)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响、降低或增大第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力,或者优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的能力之外还共同具有的特征。49.本文还提供了设计优先影响、降低或增大第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平,或者优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的化合物的方法,所述方法包括:(a)执行鉴定本文所公开的复数种化合物的方法;(b)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响、降低或增大第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力,或者优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的能力之外还共同具有的特征;以及(c)设计包含所鉴定出的特征的化合物,从而设计优先影响、降低或增大第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平,或者优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的化合物。50.本文还提供了鉴定可用于治疗有需要的个体的疾病的化合物的方法,所述方法包括:执行鉴定本文所公开的化合物的方法,其中第一组的一种或多种靶凝聚物与所述疾病相关联;以及鉴定优先影响、降低或增大第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平或者优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合从而对治疗所述疾病有用的化合物。在一些实施方案中,所述疾病是神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫性疾病、心脏疾病或代谢疾病。附图说明51.图1是荧光显微照片,其示出了在用或不用硫辛酰胺处理的情况下,应激细胞中fus、eif3和g3bp1的水平。52.图2是荧光显微照片,其示出了在用或不用azd4547、奥米帕西(omipalisib)和tg101209处理的情况下,应激细胞中fus、eif3和g3bp1的水平。53.图3是荧光显微照片,其示出了在用或不用gw9508、布雷菲德菌素a、azd3463和酮色林处理的情况下,应激细胞中fus、eif3和g3bp1的水平。54.图4是荧光显微照片,其示出了在用或不用azd8931、ym155和beta-拉帕醌处理的情况下,应激细胞中fus、eif3和g3bp1的水平。55.图5是荧光显微照片,其示出了在用或不用硫辛酰胺处理的情况下,应激细胞中fus、eif3和g3bp1的水平。56.图6是荧光显微照片,其示出了在用或不用p121、pf-04691502和tg101209处理的情况下,应激细胞中fus、eif3和g3bp1的水平。57.图7是荧光显微照片,其示出了在用或不用柯里膦o(coriphosphine o)处理的情况下,应激细胞中fus、eif3和g3bp1的水平。58.图8是荧光显微照片,其示出了在用或不用ym155、beta-拉帕醌和双吲哚马来酰亚胺ix处理的情况下,应激细胞中fus、eif3和g3bp1的水平。59.图9是荧光显微照片,其示出了在用或不用西地尼布处理的情况下,应激细胞中fus、eif3和g3bp1的水平。60.图10是荧光显微照片,其示出了在用或不用matisinib处理的情况下,携带bac fus-gfp的应激hela细胞以及应急人ipsc细胞中fus、eif3和g3bp1的水平。61.图11是用ym155处理过的携带bac fus-gfp的应激hela细胞的应激颗粒中fus、eif3和g3bp1的剂量反应曲线图。具体实施方式62.异常凝聚物形成和/或凝固已经与包括神经退行性疾病(诸如als)在内一些疾病相关联。以前,对可用于治疗与异常凝聚物相关联的疾病的化合物的药物筛选聚焦于筛选阻止凝聚物形成和/或完全溶解凝聚物的药物。本技术的公开内容至少部分地基于本发明人的独特见解和意想不到的发现,即可以开发筛选来鉴定选择性地改变凝聚物(诸如凝聚物的组成)而不破坏整个凝聚物或不破坏某些其它凝聚物的化合物。本文所公开的方法实现了用于筛选和鉴定具有以下特异性中的任何一种或多种特异性的化合物或其部分的技术:选择性地调节凝聚物中大分子的包含或排除(大分子特异性);选择性地影响一种类型的凝聚物而不影响另一种类型的凝聚物(凝聚物特异性);以及选择性地影响一种类型的组织而不是另一种类型的组织中的凝聚物(组织特异性)。鉴定和开发具有对特定大分子的关于凝聚物的行为的选择性控制和/或对受影响的凝聚物的选择性控制和/或对受影响的组织类型的选择性控制的化合物是用于在最小化脱靶活性的同时逆转疾病表型的治疗干预的有力策略。例如,可选择性地改变凝聚物的组成、凝聚物的特定类型,和/或特定组织类型中的凝聚物的化合物可用于精确地根据与疾病治疗相关联的需求,特异性地抑制或激活生物途径。63.因此,在一些方面中,本文提供了鉴定具有以下特异性中的任何一种或多种特异性的化合物的方法:大分子特异性、凝聚物特异性和组织特异性,所述方法包括确定第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平,以及将缔合水平与参考水平进行比较以鉴定具有所述特异性中的一种或多种特异性的化合物。在一些实施方案中,所述方法鉴定具有大分子特异性的化合物。在一些实施方案中,所述方法鉴定具有凝聚物特异性的化合物。在一些实施方案中,所述方法鉴定具有组织(例如,细胞类型)特异性的化合物。在一些实施方案中,所述方法鉴定具有大分子特异性和凝聚物特异性的化合物。在一些实施方案中,所述方法鉴定具有大分子特异性和组织(例如,细胞类型)特异性的化合物。在一些实施方案中,所述方法鉴定具有凝聚物特异性和组织(例如,细胞类型)特异性的化合物。在一些实施方案中,所述方法鉴定具有大分子特异性、凝聚物特异性和组织(例如,细胞类型)特异性的化合物。64.在其它方面中,本文提供了鉴定优先影响(诸如优先增大或优先降低)第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法。65.本文还提供了鉴定优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的化合物的方法。66.如本文所述,所述鉴定化合物的方法可用于例如鉴定、表征和开发能够改变大分子的关于凝聚物的行为(包括用于治疗个体的疾病的行为)的化合物或其部分。67.定义68.出于解释本说明书的目的,将应用以下定义,并且在适当时,以单数形式使用的术语也将包括复数,反之亦然。在下文提出的任何定义与以引用方式并入本文的任何文件相冲突的情况下,应以所提出的定义为准。69.术语“多肽”和“蛋白质”可互换地用来指氨基酸残基的聚合物,并且不限于最小长度。此类氨基酸残基聚合物可含有天然或非天然的氨基酸残基,并且包括但不限于氨基酸残基的肽、寡肽、二聚体、三聚体和多聚体。所述定义涵盖了全长蛋白质及其片段两者。所述术语还包括多肽的翻译后修饰,例如糖基化、唾液酸化、乙酰化、磷酸化等。70.如本文所用,“细胞组合物”是包含至少一种细胞的组合物。示例性组合物包括组织样品或培养的细胞。71.如本文所用,“凝聚物”意指通过一种或多种蛋白质和/或其它大分子的相分离(包括相分离的所有阶段)形成的非膜包封的隔室。72.如本文所用,术语“包括”、“具有”、“含有”和“包含”和其它类似形式及其语法等同物意在在含义上是等同的并且是开放式的,即在这些词中的任何一个词后面跟随一个或多个项目并不意味着是详尽地列出此类一个或多个项目或者并不意味着仅限于所列出的一个或多个项目。例如,“包含”组分a、b和c的物品可以由(即,仅含有)组分a、b和c组成,或者可以不仅含有组分a、b和c,而且还含有一种或多种其它组分。因此,意图并应理解“包括”及其类似形式以及其语法等同物,包括对“基本上由……组成”或“由……组成”的实施方案的公开。73.在提供数值范围的情况下,应理解,该范围的上限和下限之间达下限十分之一单位(除非上下文另有明确规定)的每个中间值和在所陈述范围内的任何其他陈述值或中间值都被涵盖在本公开中,受所陈述范围内的任何明确排除的限值限制。在所陈述范围包括一个或两个限值的情况下,不包括这些被包括的限值中的一者或两者的范围也被包括在本公开中。74.本文中对“约”某数值或参数的提及包括(并描述)涉及该数值或参数本身的变化。例如,提及“约x”的描述包括对“x”的描述。75.如本文中(包括在所附根据权利要求书中)所用,单数形式“一个”、“或”和“该/所述”包括复数所指对象,除非上下文另有明确规定。76.本文所使用的小节标题仅出于组织性目的并且不应被解释为限制所描述的主题。77.鉴定化合物的方法78.本文提供了鉴定具有以下特异性中的任何一种或多种特异性的化合物的方法:大分子特异性、凝聚物特异性和组织特异性。79.在一些实施方案中,所述鉴定方法包括(a)使组合物与化合物接触,其中(i)所述组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平;以及(c)将所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平与参考水平进行比较以鉴定具有以下特异性中的一种或多种特异性的化合物:大分子特异性、凝聚物特异性和组织特异性。在一些实施方案中,所述组合物是细胞组合物,例如细胞培养物。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物在特定组织类型(例如,细胞类型)中。80.在一些实施方案中,提供了一种鉴定具有大分子特异性的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法包括(a)使组合物与化合物接触,其中(i)所述组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平;以及(c)将所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平与参考水平进行比较以鉴定具有大分子特异性的化合物,其中所述参考水平包括以下中的任何一者或多者:(i)当不使所述组合物与所述化合物接触时第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平,(ii)一种或多种其它大分子与同所述化合物接触的组合物中的所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平,(iii)当不使所述组合物与所述化合物接触时一种或多种其它大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,参考水平是第二大分子与所述组合物中的所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,参考水平是第一大分子与参考凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,第一大分子、所述一种或多种靶凝聚物和参考凝聚物在同一组合物中。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物和参考凝聚物在不同的组合物中。在一些实施方案中,参考水平是在未用所述化合物处理的参考体系中第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,将参考体系用媒介物对照处理。在一些实施方案中,所述组合物是细胞组合物。在其中所述组合物是细胞组合物的一些实施方案中,所述组合物和参考体系包含相同的细胞类型。在一些实施方案中,本文所述的方法可用于鉴定对单一大分子表现出特异性(诸如表现出与单一大分子相关联的在与凝聚物相互作用方面的作用和/或活性)的化合物。在一些实施方案中,本文所述的方法可用于鉴定对一组大分子表现出特异性(诸如表现出与该一组大分子相关联的在与凝聚物相互作用方面的作用和/或活性)的化合物。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物在特定组织类型(例如,细胞类型)中。在一些实施方案中,所述方进一步包括评定所述化合物的凝聚物特异性和/或组织特异性。81.在一些实施方案中,提供了一种鉴定具有凝聚物特异性的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法包括(a)使组合物与化合物接触,其中(i)所述组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平;以及(c)将所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平与参考水平进行比较以鉴定具有凝聚物特异性的化合物,其中所述参考水平包括以下中的任何一者或多者:(i)第一大分子与另一种凝聚物的缔合水平(在所述化合物存在或不存在的情况下),(ii)一种或多种其它大分子与另一种凝聚物的缔合水平(在所述化合物存在或不存在的情况下),(iii)一种或多种其它大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平(在所述化合物存在或不存在的情况下),(iv)所述一种或多种靶凝聚物的特征,诸如大小、数目、体积(或凝聚物组分的特征,诸如分布、量、扩散系数),和(v)另一种凝聚物的特征,诸如大小、数目、体积(或凝聚物组分的特征,诸如分布、量、扩散系数)。在一些实施方案中,参考水平是第二大分子与参考凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,第一大分子和第二大分子是相同的。在一些实施方案中,第一大分子和第二大分子是不同的。在一些实施方案中,第二大分子和参考凝聚物与第一大分子和所述一种或多种靶凝聚物在同一组合物中。在一些实施方案中,所述组合物是细胞组合物。在其中所述组合物是细胞组合物的一些实施方案中,所述组合物和参考体系包含相同的细胞类型。在一些实施方案中,所述方法包括(a)使组合物与化合物接触,其中(i)所述组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定所述一种或多种靶凝聚物的特征;以及(c)将所述一种或多种靶凝聚物的特征与参考凝聚物的特征进行比较以鉴定具有凝聚物特异性的化合物。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物的特征是以下中的一者或多者:(i)所述一种或多种靶凝聚物中存在的第一大分子的量;(ii)所述一种或多种靶凝聚物的大小;(iii)所述一种或多种靶凝聚物的表面积;(iv)所述一种或多种靶凝聚物的体积;(v)所述一种或多种靶凝聚物的量,诸如总量;(vi)所述一种或多种靶凝聚物的数目;以及(vii)所述一种或多种靶凝聚物的数目和大小。在一些实施方案中,所述参考凝聚物的特征是以下中的一者或多者:(i)所述参考凝聚物中存在的组分诸如大分子的量;(ii)所述参考凝聚物的大小;(iii)所述参考凝聚物的表面积;(iv)所述参考凝聚物的体积;(v)所述参考凝聚物的量,诸如总量;(vi)所述参考凝聚物的数目;以及(vii)所述参考凝聚物的数目和大小。在一些实施方案中,所比较的特征是对于所述一种或多种靶凝聚物和参考凝聚物两者相同的特征。在一些实施方案中,本文所述的方法可用于鉴定在单一凝聚物类型中表现出特异性(诸如表现出与单一凝聚物类型相关联的作用和/或活性)的化合物。在一些实施方案中,本文所述的方法可用于鉴定在一组凝聚物类型,诸如一组均包含第一大分子的凝聚物类型中表现出特异性(诸如表现出与该组凝聚物类型相关联的作用和/或活性)的化合物。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物在特定组织类型(例如,细胞类型)中。在一些实施方案中,所述方进一步包括评定所述化合物的大分子特异性和/或组织特异性。82.在一些实施方案中,提供了一种鉴定具有组织(或细胞类型)特异性的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法包括(a)使包含细胞的组合物与化合物接触,其中(i)所述组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平;以及(c)将所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平与参考水平进行比较以鉴定具有组织特异性的化合物,其中所述参考水平包括以下中的任何一者或多者:(i)所述第一大分子与同所述组合物的细胞的细胞类型不同的另一种细胞中的所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平(在所述化合物存在或不存在的情况下),(ii)所述第一大分子与所述组合物的细胞中的另一种凝聚物的缔合水平(在所述化合物存在或不存在的情况下),(iii)所述第一大分子与同所述组合物的细胞的细胞类型不同的另一种细胞中的另一种凝聚物的缔合水平(在所述化合物存在或不存在的情况下);(iv)一种或多种其它大分子与所述组合物的细胞中的所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平(在所述化合物存在或不存在的情况下);(v)一种或多种其它大分子与所述组合物的细胞中的另一种凝聚物的缔合水平(在所述化合物存在或不存在的情况下);(vi)一种或多种其它大分子与同所述组合物的细胞的细胞类型不同的另一种细胞中的所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平(在所述化合物存在或不存在的情况下);(vii)一种或多种其它大分子与同所述组合物的细胞的细胞类型不同的另一种细胞中的另一种凝聚物的缔合水平(在所述化合物存在或不存在的情况下),(viii)所述一种或多种靶凝聚物的特征,诸如大小、数目、体积(或凝聚物组分的特征,诸如分布、量、扩散系数),(ix)在与所述组合物的细胞的细胞类型不同的另一种细胞中的所述一种或多种靶凝聚物的特征,诸如大小、数目、体积(或凝聚物组分的特征,诸如分布、量、扩散系数),(x)所述组合物的细胞中的另一种凝聚物的特征,诸如大小、数目、体积(或凝聚物组分的特征,诸如分布、量、扩散系数),和(xi)与所述组合物的细胞的细胞类型不同的另一种细胞中的另一种凝聚物的特征,诸如大小、数目、体积(或凝聚物组分的特征,诸如分布、量、扩散系数)。在一些实施方案中,参考水平是参考体系中第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平,其中所述参考体系是针对与包含所述一种或多种靶凝聚物的组合物不同的组织(或细胞)类型的模型。在一些实施方案中,使参考体系与化合物接触。在一些实施方案中,所述组合物是细胞组合物。在其中组合物是细胞组合物的一些实施方案中,组合物和参考体系包含不同的细胞类型。在一些实施方案中,本文所述的方法可用于鉴定在单一组织或细胞类型中表现出特异性(诸如表现出与单一组织或细胞类型中的凝聚物相关联的作用和/或活性)的化合物。在一些实施方案中,本文所述的方法可用于鉴定在一组组织或细胞类型,诸如一组均包含第一大分子和所述一种或多种靶凝聚物的组织或细胞类型的组织或细胞类型中表现出特异性(诸如表现出与该组组织或细胞类型中的凝聚物相关联的作用和/或活性)的化合物。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物在特定组织类型(例如,细胞类型)中。在一些实施方案中,所述方进一步包括评定所述化合物的大分子特异性和/或凝聚物特异性。83.例如,在一些实施方案中,本文所述的方法可用于鉴定这样的化合物,所述化合物相较于第二细胞类型而言优先影响第一细胞类型中一种或多种大分子(例如,第一大分子、一种或多种其它大分子,和/或一种或多种参考分子)与一种或多种靶凝聚物的缔合,诸如相较于第二细胞类型而言优先影响第一细胞类型中任何大分子与靶凝聚物的缔合(下文也称为作为“凝聚物+细胞类型选择性”)。在一些实施方案中,所述方法包括:1)将在所述化合物的存在下第一细胞类型组合物中一种或多种大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平与在所述化合物的存在下第二细胞类型组合物中所述一种或多种大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平进行比较,以及2)将在所述化合物的存在下第一细胞类型组合物中所述一种或多种大分子与一种或多种其它凝聚物的缔合水平与在所述化合物的存在下第二细胞类型组合物中所述一种或多种大分子与所述一种或多种其它凝聚物的缔合水平进行比较,如果a)第一细胞类型组合物中所述一种或多种大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第二细胞类型组合物中所述一种或多种大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平改变得较多(例如,至少多约2倍),并且b)第一细胞类型组合物中所述一种或多种大分子与所述一种或多种其它凝聚物的缔合水平与第二细胞类型组合物中所述一种或多种大分子与所述一种或多种其它凝聚物的缔合水平相比未改变,或未显著改变(例如,改变小于约2倍),则所述化合物被鉴定为相较于第二细胞类型而言优先影响第一细胞类型中一种或多种大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合。在一些实施方案中,所述方法进一步包括:1)将在所述化合物的存在下第一细胞类型组合物中第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平与在所述化合物的存在下第二细胞类型组合物中第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平进行比较,以及2)将在所述化合物的存在下第一细胞类型组合物中第二大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平与在所述化合物的存在下第二细胞类型组合物中所述第二大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平进行比较;如果化合物相较于第二细胞类型对第一细胞类型中第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合的优先影响与所述化合物相较于第二细胞类型对第一细胞类型中第二大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合的优先影响类似(例如,在约2倍范围内),则所述化合物不被鉴定为对大分子类型具有优先选择性。84.在一些实施方案中,本文所述的方法可用于鉴定这样的化合物,所述化合物相较于第二细胞类型而言优先影响第一细胞类型中第一大分子与一种或多种凝聚物(例如,一种或多种靶凝聚物、一种或多种其它凝聚物,和/或一种或多种参考凝聚物)的缔合,诸如相较于第二细胞类型而言优先影响第一细胞类型中第一大分子与任何凝聚物的缔合(下文也称为“大分子+细胞类型选择性”)。在一些实施方案中,所述方法包括:1)将在所述化合物的存在下第一细胞类型组合物中第一大分子与一种或多种凝聚物的缔合水平与在所述化合物的存在下第二细胞类型组合物中所述第一大分子与所述一种或多种凝聚物的缔合水平进行比较,以及2)将在所述化合物的存在下第一细胞类型组合物中一种或多种其它大分子与所述一种或多种凝聚物的缔合水平与在所述化合物的存在下第二细胞类型组合物中所述一种或多种其它大分子与所述一种或多种凝聚物的缔合水平进行比较,如果a)第一细胞类型组合物中所述第一大分子与所述一种或多种凝聚物的缔合水平相较于第二细胞类型组合物中所述第一大分子与所述一种或多种凝聚物的缔合水平改变得较多(例如,至少要多约2倍),并且b)第一细胞类型组合物中所述一种或多种其它大分子与所述一种或多种凝聚物的缔合水平与第二细胞类型组合物中所述一种或多种其它大分子与所述一种或多种凝聚物的缔合水平相比未改变,或未显著改变(例如,改变小于约2倍),则所述化合物被鉴定为相较于第二细胞类型而言优先影响第一细胞类型中所述第一大分子与一种或多种凝聚物的缔合。85.在一些实施方案中,本文所述的方法包括将第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平与参考水平进行比较。如本文所述,参考水平提供了鉴定化合物是否表现出以下特异性中的任何一种或多种特异性所需的比较:选择性地调节凝聚物中大分子的包含或排除(大分子特异性);选择性地影响一种类型的凝聚物而不影响另一种类型的凝聚物(凝聚物特异性);以及选择性地影响一种类型的组织而不是另一种类型的组织中的凝聚物(组织特异性)。在一些实施方案中,第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平是通过以下中的任何一者或多者获得/评定的:(i)在所述一种或多种靶凝聚物中的第一大分子的量(诸如数量,例如绝对数量);(ii)不在所述一种或多种靶凝聚物中的第一大分子的量(诸如数量,例如绝对数量);(iii)来自所述一种或多种靶凝聚物中的第一大分子的信号强度;(iv)包含第一大分子的所述一种或多种靶凝聚物的数目;(v)包含第一大分子的所述一种或多种靶凝聚物的大小;(vi)包含第一大分子的所述一种或多种靶凝聚物的表面积;(vii)包含第一大分子的所述一种或多种靶凝聚物的体积;以及(vii)包含第一大分子的所述一种或多种靶凝聚物的数目和大小。本文所述的参考水平可以以与针对本文所述的其它大分子(诸如第一大分子)所述的方式类似的方式获得/评定。86.在本文所述的实施方案中的任何实施方案中,在多于一种化合物浓度下评定缔合水平,诸如第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,所述方法包括使用从在多于一种化合物浓度下的分析获得的信息确定剂量反应曲线(类似于ic50曲线)。在一些实施方案中,所述方法包括使用剂量反应曲线确定化合物的效力(类似于ic50)。在一些实施方案中,所述方法包括鉴定具有以下特异性中的任何一种或多种特异性的化合物:大分子特异性、凝聚物特异性和组织特异性,其中所述方法包括将针对化合物与一种或多种靶凝聚物获得的剂量反应曲线与参考剂量反应曲线进行比较。在一些实施方案中,所述方法包括鉴定具有以下特异性中的任何一种或多种特异性的化合物:大分子特异性、凝聚物特异性和组织特异性,其中所述方法包括将针对化合物与一种或多种靶凝聚物获得的效力与参考效力进行比较。87.在一些实施方案中,本文提供了鉴定化合物的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;以及(b)确定第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平,以及至少一种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先影响第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先增大第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先降低第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定可用于治疗有需要的个体的疾病的化合物的方法,其中一种或多种靶凝聚物与所述疾病相关联。在一些实施方案中,所述疾病是神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫性疾病、心脏疾病或代谢疾病。88.在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物仅在疾病(或应激)状态下存在。在一些实施方案中,与健康(或非应激)状态相比,所述一种或多种靶凝聚物在疾病(或应激)状态下具有以下特征中的一种或多种特征的变化:(i)所述一种或多种靶凝聚物的位置;(ii)所述一种或多种靶凝聚物和/或其组分(例如,第一大分子)的分布;(iii)所述一种或多种靶凝聚物的数目;(iv)所述一种或多种靶凝聚物的大小;(v)所述一种或多种靶凝聚物与参考凝聚物的量之比;(vi)与所述一种或多种靶凝聚物相关联的功能活性;(vii)所述一种或多种靶凝聚物的组成;(viii)所述一种或多种靶凝聚物与生物分子的共定位;(ix)所述一种或多种靶凝聚物的组分(例如,第一大分子)的扩散系数;(x)所述一种或多种靶凝聚物的稳定性;(xi)所述一种或多种靶凝聚物的溶解或大小减小;(xii)所述一种或多种靶凝聚物的表面积;(xiii)所述一种或多种靶凝聚物的球形度;(xiv)所述一种或多种靶凝聚物的流动性;(xv)所述一种或多种靶凝聚物的凝固;(xvi)凝聚物组分(例如,第一大分子)的位置;(xvii)凝聚物组分(例如,第一大分子)或其前体的量;(xviii)生物分子(例如,第一大分子)向所述一种或多种靶凝聚物中的凝聚物分配;(xix)与凝聚物组分(例如,第一大分子)相关联的功能活性;(xx)凝聚物组分(例如,第一大分子)的聚集;(xxi)凝聚物组分(例如,第一大分子)的翻译后修饰状态;和(xxii)凝聚物组分(例如,第一大分子)的降解产物的量。在一些实施方案中,在疾病(或应激)状态下第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平增大,并且本文所述的方法被用于鉴定相较于参考水平而言选择性地降低第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合的化合物。例如,本文所述的方法可用于鉴定相较于另一种生物分子(例如,不是第一大分子的凝聚物组分)与一种或多种靶凝聚物的缔合而言优先降低第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合的化合物。在一些实施方案中,本文所述的方法可用于鉴定相较于第一大分子与另一种凝聚物的缔合或第二大分子与另一种凝聚物的缔合而言优先降低第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合的化合物。在一些实施方案中,本文所述的方法可用于鉴定这样的化合物,所述化合物相较于健康(或非应激)组织或细胞类型中第一大分子与一种或多种靶凝聚物或另一种凝聚物的缔合而言,或者相较于健康(或非应激)组织或细胞类型中第二大分子与一种或多种靶凝聚物或另一种凝聚物的缔合而言,优先降低患病(或应激)组织或细胞类型中第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合。在一些实施方案中,第二大分子和第一大分子是不同的。在一些实施方案中,第二大分子是参考大分子(例如,已知在健康或非应激条件或细胞/组织类型下与靶凝聚物缔合,或已知在健康或非应激条件或细胞/组织类型下不与靶凝聚物缔合的大分子)。89.本文还提供了鉴定复数种化合物的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平,以及至少一种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平;以及(c)对复数种化合物执行步骤(a)和(b)。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先影响第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平的复数种化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先增大第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平的复数种化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先降低第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平的复数种化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法进一步包括比较在与不同化合物接触时第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,所述方法进一步包括对基于在优先增大(或降低)第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平方面的作用和/或活性鉴定出的复数种化合物进行排名。在一些实施方案中,所述比较或排名是基于所述化合物在增大(或降低)第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平方面的绝对作用和/或活性。在一些实施方案中,所述比较或排名是基于在相较于与至少一种附加大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平而言优先增大(或降低)第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平方面的相对作用和/或活性。在一些实施方案中,所述方法是鉴定可用于治疗有需要的个体的疾病的复数种化合物的方法,其中一种或多种靶凝聚物与所述疾病相关联。在一些实施方案中,所述疾病是神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫性疾病、心脏疾病或代谢疾病。90.在一些实施方案中,所述方法进一步包括鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响、降低或增大第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力之外还共同具有的特征。在一些实施方案中,所述方法进一步包括鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力之外还共同具有的特征。在一些实施方案中,所述方法进一步包括鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先降低第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力之外还共同具有的特征。在一些实施方案中,所述方法进一步包括鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先增大第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力之外还共同具有的特征。在一些实施方案中,所述方法进一步包括执行步骤(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;以及步骤(b)针对一种或多种包含所鉴定出的特征的附加测试化合物,确定第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平,以及至少一种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,所述方法进一步包括对一种或多种不包含所鉴定出的特征的附加测试化合物执行步骤(a)和(b)。在一些实施方案中,所述特征是化合物部分。91.在一些实施方案中,第一参考水平是在不存在所述化合物的情况确定的第一大分子与一种或多种参考凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,每种(或至少一种)附加大分子的参考水平是在不存在所述化合物的情况下确定的每种(或至少一种)附加大分子与一种或多种参考凝聚物的缔合水平。92.在一些实施方案中,如果所述化合物导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第一参考水平发生的改变多于所述化合物导致每种(或至少一种)附加大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于每种(或至少一种)附加大分子的参考水平发生的改变,则所述化合物优先影响所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,如果所述化合物导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第一参考水平发生的增大多于所述化合物导致每种(或至少一种)附加大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于每种(或至少一种)附加大分子的参考水平发生的增大,则所述化合物优先增大所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,如果所述化合物导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第一参考水平发生的降低多于所述化合物导致每种(或至少一种)附加大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于每种(或至少一种)附加大分子的参考水平发生的降低,则所述化合物优先降低所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平。93.在一些实施方案中,所述化合物导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平与第一参考水平相比发生增大。在一些实施方案中,所述化合物导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平与第一参考水平相比发生降低。在一些实施方案中,所述化合物导致每种(或至少一种)附加大分子的缔合水平与每种(或至少一种)附加大分子的参考水平相比发生增大,或者不导致每种(或至少一种)附加大分子的缔合水平与每种(或至少一种)附加大分子的参考水平相比发生可测量地改变。在一些实施方案中,所述化合物导致每种(或至少一种)附加大分子的缔合水平与每种(或至少一种)附加大分子的参考水平相比发生降低,或者不导致每种(或至少一种)附加大分子的缔合水平与每种(或至少一种)附加大分子的参考水平相比发生可测量地改变。在一些实施方案中,所述化合物不导致每种(或至少一种)附加大分子的缔合水平与每种(或至少一种)附加大分子的参考水平相比发生可测量地改变。在一些实施方案中,所述化合物不导致每种(或至少一种)附加大分子的缔合水平与每种(或至少一种)附加大分子的参考水平相比发生可测量地增大。在一些实施方案中,所述化合物不导致每种(或至少一种)附加大分子的缔合水平与每种(或至少一种)附加大分子的参考水平相比发生可测量地降低。在一些实施方案中,该方法包括确定第一参考水平和每种(或至少一种)附加大分子的参考水平。94.在一些实施方案中,所述化合物导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平与第一参考水平相比发生增大,并且所述化合物不导致每种(或至少一种)附加大分子的缔合水平与每种(或至少一种)附加大分子的参考水平相比发生增大;或者所述化合物导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平与第一参考水平相比发生降低,并且所述化合物不导致每种(或至少一种)附加大分子的缔合水平与每种(或至少一种)附加大分子的参考水平相比发生增大。在一些实施方案中,所述化合物导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平与第一参考水平相比发生增大,并且所述化合物不导致每种(或至少一种)附加大分子的缔合水平与每种(或至少一种)附加大分子的参考水平相比发生增大。在一些实施方案中,所述化合物导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平与第一参考水平相比发生降低,并且所述化合物不导致每种(或至少一种)附加大分子的缔合水平与每种(或至少一种)附加大分子的参考水平相比发生降低。95.在一些实施方案中,如果所述化合物导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第一参考水平发生的改变多于所述化合物导致每种(或至少一种)附加大分子的所述水平相较于每种(或至少一种)附加大分子的参考水平发生的改变,并且差异是统计学上显著的,则所述化合物优先影响所述第一大分子的所述水平。在一些实施方案中,如果所述化合物导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第一参考水平发生的增大多于所述化合物导致每种(或至少一种)附加大分子的所述水平相较于每种(或至少一种)附加大分子的参考水平发生的改变,并且差异是统计学上显著的,则所述化合物优先增大所述第一大分子的所述水平。在一些实施方案中,如果所述化合物导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第一参考水平发生的降低多于所述化合物导致每种(或至少一种)附加大分子的所述水平相较于每种(或至少一种)附加大分子的参考水平发生的改变,并且差异是统计学上显著的,则所述化合物优先降低所述第一大分子的所述水平。在一些实施方案中,如果p《0.05,诸如p《0.025、0.01、0.005或0.001,则差异是统计学上显著的。确定统计显著性的方法是已知的,诸如t检验、方差分析(anova)和fisher方法。适当测试的选择可以由本领域技术人员确定。96.在一些实施方案中,如果所述化合物导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第一参考水平发生的改变比所述化合物导致每种(或至少一种)附加大分子的所述水平相较于每种(或至少一种)附加大分子的参考水平发生的改变多至少约2倍,诸如2.5倍、3倍、4倍、5倍,或10倍中的至少约任一者倍数,则所述化合物优先影响所述第一大分子的所述水平。在一些实施方案中,如果所述化合物导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第一参考水平发生的增大比所述化合物导致每种(或至少一种)附加大分子的所述水平相较于每种(或至少一种)附加大分子的参考水平发生的改变多至少约2倍,诸如2.5倍、3倍、4倍、5倍,或10倍中的至少约任一者倍数,则所述化合物优先增大所述第一大分子的所述水平。在一些实施方案中,如果所述化合物导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第一参考水平发生的降低比所述化合物导致每种(或至少一种)附加大分子的所述水平相较于每种(或至少一种)附加大分子的参考水平发生的改变多至少约2倍,诸如2.5倍、3倍、4倍、5倍,或10倍中的至少约任一者倍数,则所述化合物优先降低所述第一大分子的所述水平。在一些实施方案中,如果所述化合物导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第一参考水平发生的改变比所述化合物导致每种(或至少一种)附加大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于每种(或至少一种)附加大分子的参考水平发生的改变多0.25倍、0.5倍、0.75倍、1倍、1.25倍、1.5倍、1.75倍、2倍、2.5倍、3倍、4倍、5倍,或10倍中的至少约任一者倍数,则所述化合物优先影响所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平。97.在一些实施方案中,如果所述化合物导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第一参考水平发生的改变比所述化合物导致第二大分子与参考凝聚物的缔合水平相较于参考水平发生的改变多(多诸如0.25倍、0.5倍、0.75倍、1倍、1.25倍、1.5倍、1.75倍、2倍、2.5倍、3倍、4倍、5倍,或10倍中的至少约任一者倍数),则所述化合物优先影响所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,第一参考水平是在不存在所述化合物的情况下确定的第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,参考水平是在不存在所述化合物的情况下确定的第二大分子与参考凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,第一大分子和第二大分子是相同的。在一些实施方案中,第一大分子和第二大分子是不同的。98.在一些实施方案中,如果所述化合物导致靶细胞或组织类型中第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第一参考水平发生的改变比所述化合物导致参考细胞或组织类型中第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于参考水平发生的改变多(多诸如0.25倍、0.5倍、0.75倍、1倍、1.25倍、1.5倍、1.75倍、2倍、2.5倍、3倍、4倍、5倍,或10倍中的至少约任一者倍数),则所述化合物优先影响所述靶细胞或组织类型中所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,第一参考水平是在不存在所述化合物的情况下确定的所述靶细胞或组织类型中第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,参考水平是在不存在所述化合物的情况下确定的参考细胞或组织类型中第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平。99.在一些实施方案中,所述水平是绝对量。在一些实施方案中,所述水平是相对水平,诸如1)大分子的量与一种或多种(靶或参考)凝聚物的另一组分的量相比而得到的相对水平;2)与一种或多种(靶或参考)凝聚物缔合的大分子的量与细胞或另一种细胞组分(诸如另一种凝聚物)中或细胞器中的大分子的量相比而得到的相对水平;或3)一种组织或细胞类型中的与一种或多种(靶或参考)凝聚物缔合的大分子的量与另一组织或细胞类型中的与一种或多种(靶或参考)凝聚物缔合的大分子的量相比而得到的相对水平。100.在一些实施方案中,参考是实验对照。在一些实施方案中,大分子的参考水平是所述大分子与一种或多种参考凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物和所述述一种或多种参考凝聚物位于细胞组合物的不同部分中。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物和所述一种或多种参考凝聚物位于细胞的不同部分中。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物和所述一种或多种参考凝聚物位于不同的细胞组合物中。在一些实施方案中,包含一种或多种靶凝聚物的细胞组合物是第一细胞组合物,并且参考水平是在第二细胞组合物中确定的。在一些实施方案中,参考水平是尚未接触所述化合物的细胞组合物中大分子与一种或多种靶凝聚物或一种或多种参考凝聚物的缔合水平。101.在一些实施方案中,参考水平是以使得可以评定化合物的有意义结果的方式确定的。例如,在一些实施方案中,参考水平是在参考细胞组合物中确定的,其中所述参考细胞组合物是以与同所述化合物接触的细胞组合物类似的方式制备的,不同之处在于所述参考细胞组合物不经受所述化合物或与所述化合物接触的步骤。102.本文提供了鉴定化合物的方法,所述方法包括:(a)使第一细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述第一细胞组合物包含第一组的一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述第一组的一种或多种靶凝聚物是在使所述第一细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平以及至少一种附加大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平;(c)使第二细胞组合物与所述化合物接触,其中(i)所述第二细胞组合物包含第二组的一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述第二组的一种或多种靶凝聚物是在使所述第二细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;以及(d)确定所述第一大分子与所述第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平以及第二大分子与所述第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,第二大分子和第一大分子是不同的。在一些实施方案中,第二大分子是所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子。103.本文还提供了鉴定化合物的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含第一组的一种或多种靶凝聚物和/或第二组的一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述第一组和/或第二组的一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平以及至少一种附加大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平;(c)确定所述第一大分子与所述第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平以及第二大分子与所述第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,第二大分子和第一大分子是不同的。在一些实施方案中,第二大分子是所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子。104.在一些实施方案中,本文所述的大分子是第一大分子。在一些实施方案中,所述大分子不是第一大分子。在一些实施方案中,所述大分子是所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子。在一些实施方案中,所述大分子是参考大分子(例如,已知在健康或非应激条件或细胞/组织类型下与靶凝聚物缔合,或已知在健康或非应激条件或细胞/组织类型下不与靶凝聚物缔合的大分子)。在一些实施方案中,所述大分子是第一大分子,并且所述方法进一步包括确定第二大分子与第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,第二大分子和第一大分子是不同的。在一些实施方案中,第二大分子是所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子。105.在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先影响第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先增大第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先降低第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定可用于治疗有需要的个体的疾病的化合物的方法,其中第一组的一种或多种靶凝聚物与所述疾病相关联。在一些实施方案中,所述疾病是神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫性疾病、心脏疾病或代谢疾病。106.在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先影响第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的复数种化合物的方法,所述方法包括对复数种化合物执行本文所述的方法中的任何方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先增大第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的复数种化合物的方法,所述方法包括对复数种化合物执行本文所述的方法中的任何方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先降低第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的复数种化合物的方法,所述方法包括对复数种化合物执行本文所述的方法中的任何方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定可用于治疗有需要的个体的疾病的复数种化合物的方法,其中第一组的一种或多种靶凝聚物与所述疾病相关联,所述方法包括对复数种化合物执行本文所述的方法中的任何方法。在一些实施方案中,所述疾病是神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫性疾病、心脏疾病或代谢疾病。107.在一些实施方案中,如果所述化合物对所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的影响多于所述化合物对所述第一大分子与所述第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的影响,则所述化合物优先影响所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,所述化合物不影响第一大分子与第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,如果所述化合物对所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的增大多于所述化合物对所述第一大分子与所述第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的增大,则所述化合物优先增大所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,所述化合物不增大第一大分子与第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,如果所述化合物对所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的降低多于所述化合物对所述第一大分子与所述第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的降低,则所述化合物优先降低所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,所述化合物不降低第一大分子与第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。108.本文还提供了鉴定化合物的方法,所述方法包括(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;以及(b)确定第一大分子和至少一种附加大分子是否与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述方法是鉴定导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物解除缔合的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物解除缔合的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定可用于治疗有需要的个体的疾病的化合物的方法,其中一种或多种靶凝聚物与所述疾病相关联。在一些实施方案中,所述疾病是神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫性疾病、心脏疾病或代谢疾病。109.本文还提供了鉴定复数种化合物的方法,所述方法包括(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子和至少一种附加大分子是否与所述一种或多种靶凝聚物缔合;以及(c)针对复数种化合物执行步骤(a)和(b)。在一些实施方案中,所述方法是鉴定导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的复数种化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合的复数种化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物解除缔合的复数种化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的复数种化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合的复数种化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物解除缔合的复数种化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定可用于治疗有需要的个体的疾病的复数种化合物的方法,其中一种或多种靶凝聚物与所述疾病相关联。在一些实施方案中,所述疾病是神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫性疾病、心脏疾病或代谢疾病。110.在一些实施方案中,所述方法进一步包括鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的能力之外还共同具有的特征。在一些实施方案中,所述方法进一步包括鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合的能力之外还共同具有的特征。在一些实施方案中,所述方法进一步包括鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物解除缔合的能力之外还共同具有的特征。在一些实施方案中,所述方法进一步包括执行步骤(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;以及步骤(b)针对一种或多种包含所鉴定出的特征的附加测试化合物,确定第一大分子和至少一种附加大分子是否与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述方法进一步包括对一种或多种不包含所鉴定出的特征的附加测试化合物执行步骤(a)和(b)。111.在一些实施方案中,所述化合物导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述化合物不导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述化合物导致所述第一大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合;在一些实施方案中,所述化合物不导致所述第一大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。112.在一些实施方案中,所述化合物导致所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述化合物导致每种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述化合物不导致所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述化合物不导致每种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述化合物不导致所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述化合物不导致每种附加大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。113.在一些实施方案中,所述第一大分子在不存在所述化合物的情况下将与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述第一大分子在不存在所述化合物的情况下将不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,每种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,每种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述第一大分子和所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述第一大分子和每种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述第一大分子和所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述第一大分子和每种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。114.在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子在存在所述化合物的情况下与所述一种或多种靶凝聚物缔合,并且在不存在所述化合物的情况下将与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,每种附加大分子在存在所述化合物的情况下与所述一种或多种靶凝聚物缔合,并且在不存在所述化合物的情况下将与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子在存在所述化合物的情况下不与所述一种或多种靶凝聚物缔合,并且在不存在所述化合物的情况下将不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,每种附加大分子在存在所述化合物的情况下不与所述一种或多种靶凝聚物缔合,并且在不存在所述化合物的情况下将不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。115.在一些实施方案中,如果出现以下情况,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合:(1)所述化合物导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合;(2)所述化合物不导致每种(或至少一种)附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合(或导致的每种(或至少一种)附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合较少);以及(3)所述第一大分子在不存在所述化合物的情况下将不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,如果出现以下情况,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合:(1)所述化合物导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合;(2)所述化合物不导致每种(或至少一种)附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合(或导致的每种(或至少一种)附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合较少);以及(3)所述第一大分子和所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,如果出现以下情况,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合:(1)所述化合物导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合;(2)所述化合物不导致每种(或至少一种)附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合(或导致的每种(或至少一种)附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合较少);以及(3)所述第一大分子和每种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。116.在一些实施方案中,如果出现以下情况,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物解除缔合:(1)所述化合物导致所述第一大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合;(2)所述化合物不导致每种(或至少一种)附加大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合(或导致的每种(或至少一种)附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的解除缔合较少);以及(3)所述第一大分子在不存在所述化合物的情况下将与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,如果出现以下情况,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物解除缔合:(1)所述化合物导致所述第一大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合;(2)所述化合物不导致每种(或至少一种)附加大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合(或导致的每种(或至少一种)附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的解除缔合较少);以及(3)所述第一大分子和所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,如果出现以下情况,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物解除缔合:(1)所述化合物导致所述第一大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合;(2)所述化合物不导致每种(或至少一种)附加大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合(或导致的每种(或至少一种)附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的解除缔合较少);以及(3)所述第一大分子和每种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将与所述一种或多种靶凝聚物缔合。117.在一些实施方案中,所述化合物直接导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述化合物间接导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述化合物直接导致所述第一大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述化合物间接导致所述第一大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。118.在一些实施方案中,所述化合物直接导致所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述化合物间接导致所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述化合物直接导致所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述化合物间接导致所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。119.在一些实施方案中,所述化合物直接导致每种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述化合物间接导致每种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述化合物直接导致每种附加大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述化合物间接导致每种附加大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。120.在一些实施方案中,如果在使细胞组合物与化合物接触之后确定大分子(诸如第一大分子或附加大分子)与一种或多种靶凝聚物缔合并且确定所述大分子不与一种或多种参考凝聚物缔合,则所述化合物导致所述大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述一种或多种参考凝聚物是实验对照。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物和所述述一种或多种参考凝聚物位于细胞组合物的不同部分中。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物和所述一种或多种参考凝聚物位于细胞的不同部分中。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物和所述一种或多种参考凝聚物位于不同的细胞组合物中。在一些实施方案中,包含所述一种或多种靶凝聚物的细胞组合物是第一细胞组合物,并且所述一种或多种参考凝聚物在第二细胞组合物中。在一些实施方案中,第二细胞组合物未与所述化合物接触。121.在一些实施方案中,确定大分子与一种或多种参考凝聚物的缔合是以使得可以评定化合物的有意义结果的方式执行的。例如,在一些实施方案中,大分子与一种或多种参考凝聚物的缔合的确定是在参考细胞组合物中执行的,其中所述参考细胞组合物是以与同所述化合物接触的细胞组合物类似的方式制备的,不同之处在于所述参考细胞组合物不经受所述化合物或与所述化合物接触的步骤。122.在一些实施方案中,如果确定在使细胞组合物与所述化合物接触之后大分子(诸如第一大分子或附加大分子)与一种或多种靶凝聚物缔合,并且在不使所述细胞组合物与所述化合物接触的情况下所述大分子将不与所述一种或多种靶凝聚物缔合,则所述化合物导致所述大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述方法进一步包括确定所述大分子在不存在所述化合物的情况下是否与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,如果在使细胞组合物与所述化合物接触之后确定大分子(诸如第一大分子或附加大分子)与一种或多种靶凝聚物缔合,并且所述大分子不与所述一种或多种参考凝聚物缔合,则所述化合物导致所述大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述方法进一步包括确定所述大分子在不存在所述化合物的情况下是否与所述一种或多种参考凝聚物缔合。123.本文还提供了鉴定化合物的方法,所述方法包括(a)使第一细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述第一细胞组合物包含第一组的一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述第一组的一种或多种靶凝聚物是在使所述第一细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子和至少一种附加大分子是否与所述第一组的一种或多种靶凝聚物缔合;(c)使第二细胞组合物与所述化合物接触,其中(i)所述第二细胞组合物包含第二组的一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述第二组的一种或多种靶凝聚物是在使所述第二细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;以及(d)确定第二大分子是否与所述第二组的一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,第二大分子和第一大分子是相同的。在一些实施方案中,第二大分子和第一大分子是不同的。在一些实施方案中,第二大分子是所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子。在一些实施方案中,第二大分子是参考大分子(例如,已知在健康或非应激条件或细胞/组织类型下与靶凝聚物缔合,或已知在健康或非应激条件或细胞/组织类型下不与靶凝聚物缔合的大分子)。在一些实施方案中,第二大分子和第一大分子是相同的,并且所述方法进一步包括确定第三大分子(例如,不同于第一大分子和第二大分子)是否与第二组的一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,所述第三大分子是所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子。124.本文还提供了鉴定化合物的方法,所述方法包括(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含第一组的一种或多种靶凝聚物和/或第二组的一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述第一组和/或第二组的一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;以及(b)确定第一大分子和至少一种附加大分子是否与所述第一组的一种或多种靶凝聚物缔合;(c)确定第二大分子是否与所述第二组的一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,第二大分子和第一大分子是相同的。在一些实施方案中,第二大分子和第一大分子是不同的。在一些实施方案中,第二大分子是所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子。在一些实施方案中,第二大分子是参考大分子(例如,已知在健康或非应激条件或细胞/组织类型下与靶凝聚物缔合,或已知在健康或非应激条件或细胞/组织类型下不与靶凝聚物缔合的大分子)。在一些实施方案中,第二大分子和第一大分子是相同的,并且所述方法进一步包括确定第三大分子(例如,不同于第一大分子和第二大分子)是否与第二组的一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,第三大分子是所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子。125.在一些实施方案中,所述方法是鉴定导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物解除缔合的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物解除缔合的化合物的方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定可用于治疗有需要的个体的疾病的化合物的方法,其中第一组的一种或多种靶凝聚物与所述疾病相关联。在一些实施方案中,所述疾病是神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫性疾病、心脏疾病或代谢疾病。126.在一些实施方案中,所述方法是鉴定导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合的复数种化合物的方法,所述方法包括对复数种化合物执行本文所述的方法中的任何方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物解除缔合的复数种化合物的方法,所述方法包括对复数种化合物执行本文所述的方法中的任何方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的复数种化合物的方法,所述方法包括对复数种化合物执行本文所述的方法中的任何方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合的复数种化合物的方法,所述方法包括对复数种化合物执行本文所述的方法中的任何方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物解除缔合的复数种化合物的方法,所述方法包括对复数种化合物执行本文所述的方法中的任何方法。在一些实施方案中,所述方法是鉴定可用于治疗有需要的个体的疾病的复数种化合物的方法,其中第一组的一种或多种靶凝聚物与所述疾病相关联,所述方法包括对复数种化合物执行本文所述的方法中的任何方法。在一些实施方案中,所述疾病是神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫疾病、心脏疾病或代谢疾病,所述方法包括对复数种化合物执行本文所述的方法中的任何方法。127.在一些实施方案中,如果所述化合物导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合的程度多于所述化合物导致第一大分子与第二组的一种或多种靶凝聚物缔合的程度,则所述化合物优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合。在一些实施方案中,如果所述化合物导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物解除缔合的程度多于所述化合物导致第一大分子与第二组的一种或多种靶凝聚物解除缔合的程度,则所述化合物优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物解除缔合。128.本领域普通技术人员将容易地认识到包括凝聚物及其组分的状态在内的细胞过程是动态的。因此,本文所述的方法可涵盖在一种或多种靶凝聚物或其组分的生命周期中的任何点(例如,各种有丝分裂期或非有丝分裂期)时使细胞与化合物接触。例如,所述方法可涵盖例如当一种或多种靶凝聚物处于细胞的任何位置中、以任何量存在(包括不存在)、正在经历形态学变化(诸如大小或流动性的变化),或组成正在发生变化时使细胞组合物与化合物接触。在一些方面中,所述方法还可涵盖当一种或多种靶凝聚物的组分处于细胞的任何位置中、以任何量存在,或具有任何翻译后修饰状态时使细胞组合物与化合物接触。129.化合物130.在一些实施方案中,所述化合物是小分子、多肽、脂质或核酸。在一些实施方案中,所述化合物是经批准的化合物,例如美国食品和药物管理局批准用于医学治疗的化合物。在一些实施方案中,所述化合物是新化合物。在一些实施方案中,所述化合物是小分子。在一些实施方案中,所述小分子是生物碱、糖苷、吩嗪、苯酚、聚酮化合物、萜烯或四吡咯。在一些实施方案中,测试化合物是核酸。在一些实施方案中,所述化合物是sirna、mirna,或mrna。在一些实施方案中,所述化合物是非天然存在的化合物。在一些实施方案中,所述化合物具有小于约1,000da,诸如约500da或更小的分子量。在一些实施方案中,所述化合物满足lipinski五倍律法则。在一些实施方案中,所述化合物是小分子(诸如约1,000da或更小并且/或者满足lipinski五倍律法则的治疗性小分子)。在一些实施方案中,所述化合物包含可检测特征,诸如荧光特征。在一些实施方案中,所述化合物包含标记物,诸如荧光标记物。在一些实施方案中,所述化合物进一步用检测标签标记,所述检测标签为诸如荧光素、荧光多肽或放射性同位素标记物。在一些实施方案中,标签不影响所述化合物在优先导致第一大分子(或参考大分子)与一种或多种靶凝聚物(或参考凝聚物)缔合/解除缔合方面的作用和/或活性。在一些实施方案中,标记物是可使用显微技术(例如,荧光显微技术)检测的。131.在一些实施方案中,本文的方法包括添加两种或更多种化合物。因此,在一些实施方案中,本文提供了鉴定优先改变,诸如优先增大或优先降低第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平,或优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的化合物的组合的方法。在一些实施方案中,所述两种或更多种化合物均选自小分子、多肽、脂质或核酸中的任一者。在一些实施方案中,所述两种或更多种测试化合物是顺序或同时添加的。在一些实施方案中,所述两种或更多种测试化合物融合在一起。132.细胞组合物133.如本文所公开的细胞组合物是包含至少一种细胞的组合物。在一些实施方案中,所述细胞组合物包含单一细胞。在一些实施方案中,所述细胞组合物包含至少两种、三种、四种、五种、10种、25种、50种、100种、500种、1000种或更多种细胞。细胞组合物可以从各种不同的来源,诸如体内来源,诸如来自动物的体液或组织样品,或体外来源,诸如培养的细胞或培养的组织获得。体液和组织样品常常含有多种细胞类型,例如脑组织可包含神经元、胶质细胞和许多其它类型的细胞。因此,在一些实施方案中,所述细胞组合物包含至少两种、三种、四种或五种细胞类型。细胞组合物还可包含培养基,诸如细胞培养基。所述培养基可根据所使用的样品和细胞类型而变化。在一些实施方案中,所述细胞组合物包含以下中的一者或多者:氨基酸、维生素、无机盐、葡萄糖、血清、生长因子、激素和附着因子。示例性培养基包括ames培养基、具有或不具有fitton-jackson改良的bgjb培养基、click培养基、cmrl-1066培养基、fischer培养基、glascow极限必需培养基(minimum essential medium,gmem)、iscove改良杜氏培养基(iscove's modified dulbecco's medium,imdm)、l-15培养基(leibovitz)、mccoy的5a改良培养基、nctc培养基、swim的s-77培养基、waymouth培养基、william的培养基e、杜氏改良伊格尔培养基(dulbecco’s modified eagle medium,dmem)和伊格尔极限必需培养基(emem)。134.对于需要第一细胞组合物和第二细胞组合物的方法,可以使用本文所公开的任何细胞组合物。在一些实施方案中,第一细胞组合物和第二细胞组合物包含基本上相似的组分。例如,第一细胞组合物和第二细胞组合物可各自为来自源细胞组合物的样品,或者可各自通过使用相同方法组合相同组分来制备。在一些实施方案中,第一细胞组合物和第二细胞组合物包含明显不同的组分。例如,第一细胞组合物和第二细胞组合物可各自为来自不同源细胞组合物的样品,或者各自通过组合不同组分(诸如不同细胞或培养基)或使用用不同方法制备的组分来制备。在一些实施方案中,第一细胞组合物包含健康或非应激细胞或表达野生型大分子的细胞,而第二细胞组合物包含患病(例如,肿瘤细胞)或应激细胞或表达突变大分子的细胞。135.在一些实施方案中,所述细胞是微生物或动物细胞。在一些实施方案中,所述细胞是动物细胞。在一些实施方案中,所述细胞是人细胞。在一些实施方案中,所述细胞具有神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫性疾病、心脏疾病或代谢疾病的一种或多种特征。在一些实施方案中,所述细胞是hela细胞、hek293细胞、诱导多能干细胞(ipsc细胞)、心肌细胞、肌细胞、干细胞衍生细胞、神经元、癌细胞、免疫细胞,或脂肪细胞。在一些实施方案中,所述细胞是神经元。在一些实施方案中,所述细胞是癌细胞。在一些实施方案中,所述细胞是免疫细胞。在一些实施方案中,所述细胞是诱导多能干细胞(ips细胞)、hela细胞,或hek293细胞。当描述特定细胞类型时,除非另有明确说明,否则它应理解为包括源自该细胞类型的细胞。例如,除非另有明确说明,否则包含异源转基因的hela细胞将被视为hela细胞。136.在一些实施方案中,所述细胞包含被确定为失调的凝聚物。在一些实施方案中,所述细胞包含与疾病相关联的突变。在一些实施方案中,所述细胞具有神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫性疾病、心脏疾病或代谢疾病的一种或多种特征。在一些实施方案中,所述细胞已经用砷酸盐、温度变化或ph变化进行处理。137.在一些实施方案中,所述方法包括改变细胞组合物的温度,诸如将细胞组合物暴露于较低或较高的温度;改变细胞组合物的盐含量;在细胞组合物中添加或改变缓冲剂;改变细胞组合物的ph;或向细胞组合物中添加拥挤剂(crowding agent),诸如向细胞组合物中添加peg或葡聚糖。138.在一些实施方案中,所述细胞组合物中的细胞包含导致一种或多种靶凝聚物形成并且/或者修饰所述一种或多种靶凝聚物的突变。在一些实施方案中,所述突变修饰以下中的一者或多者:所述一种或多种靶凝聚物的大小、所述一种或多种靶凝聚物的形状(例如,球形度)、所述一种或多种靶凝聚物的表面积、所述一种或多种靶凝聚物的一种或多种组分的浓度、所述一种或多种靶凝聚物的位置、所述一种或多种靶凝聚物的数目、所述一种或多种靶凝聚物与参考凝聚物的量之比、与所述一种或多种靶凝聚物相关联的功能活性、所述一种或多种靶凝聚物的组成、所述一种或多种靶凝聚物与生物分子的共定位、所述一种或多种靶凝聚物的组分的扩散系数、所述一种或多种靶凝聚物的稳定性、所述一种或多种靶凝聚物的溶解或大小减小、所述一种或多种靶凝聚物的流动性、所述一种或多种靶凝聚物的凝固、凝聚物组分的位置、凝聚物组分或其前体的量、生物分子向所述一种或多种靶凝聚物中的凝聚物分配、与凝聚物组分相关脸的功能活性、凝聚物组分的聚集、凝聚物组分的翻译后修饰状态、凝聚物组分的降解产物的量,以及所述一种或多种靶凝聚物中组分的异质分布。在一些实施方案中,所述细胞组合物中的细胞包含导致凝聚物形成的突变。139.在一些实施方案中,所述细胞表达用荧光蛋白标记的蛋白质。在一些实施方案中,所述蛋白质是已知集中在一种或多种靶凝聚物中的蛋白质。在一些实施方案中,所述细胞表达第一蛋白质和第二蛋白质,其中第一蛋白质用第一标记物进行标记,其中已知所述第一蛋白质集中在第一组的一种或多种靶凝聚物中,其中所述第二蛋白质用第二标记物进行标记,其中已知所述第二蛋白质集中在第二组的一种或多种靶凝聚物中,并且其中所述第一标记物和所述第二标记物是可区分的。在一些实施方案中,所述细胞表达第一蛋白质和第二蛋白质,其中第一蛋白质用第一荧光蛋白进行标记,其中已知所述第一蛋白质集中在第一组的一种或多种靶凝聚物中,其中所述第二蛋白质用第二荧光蛋白进行标记,其中已知所述第二蛋白质集中在第二组的一种或多种靶凝聚物中,并且其中所述第一荧光蛋白和所述第二荧光蛋白是可区分的。在一些实施方案中,所述蛋白质的表达是诱导的或条件性的,例如,使用teton体系。在一些实施方案中,所述蛋白质的表达是组成型的。140.凝聚物141.在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物是2种或更多种、3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种靶凝聚物、25种或更多种、50种或更多种、75种或更多种,或100种或更多种靶凝聚物。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物是约1-1000种凝聚物,诸如1-750种、1-500种、1-250种、1-100种、10-500种、10-50种、10-20种、25-1000种、25-500种、25-250种、100-1000种,或100-500种凝聚物中的约任一者。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物是单一凝聚物类型,例如,含有共同大分子组分的凝聚物类型。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物是复数种凝聚物类型,例如,所述复数种凝聚物中的某些凝聚物含有第一大分子组分并且所述复数种凝聚物中的某些凝聚物不含第一大分子组分。在一些实施方案中,所述一种或多种参考凝聚物是2种或更多种、3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种参考凝聚物、25种或更多种、50种或更多种、75种或更多种,或100种或更多种参考凝聚物。在一些实施方案中,所述一种或多种参考凝聚物是1-1000种凝聚物,诸如1-750种、1-500种、1-250种、1-100种、10-500种、10-50种、10-20种、25-1000种、25-500种、25-250种、100-1000种或100-500种凝聚物中的约任何一者。在一些实施方案中,所述一种或多种参考凝聚物是单一凝聚物类型,例如,包含共同大分子组分的凝聚物类型。在一些实施方案中,所述一种或多种参考凝聚物是复数种凝聚物类型,例如,所述复数种凝聚物中的某些凝聚物含有第一大分子组分并且所述复数种凝聚物中的某些凝聚物不含第一大分子组分。在一些实施方案中,所述一种或多种参考凝聚物和所述一种或多种靶凝聚物不含有共同的大分子组分。在一些实施方案中,所述一种或多种参考凝聚物和所述一种或多种靶凝聚物含有共同的大分子组分。142.许多凝聚物在本领域中是众所周知的,并且许多凝聚物可以使用已知方法诸如显微术来鉴定或分析(关于示例性方法,参见basturea,g.n.(“biological condensates,”mater methods 2019;9:2794))。在一些实施方案中,所述方法进一步包括鉴定一种或多种靶凝聚物。在一些实施方案中,所述方法进一步包括鉴定一种或多种参考凝聚物。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物是细胞凝聚物。在一些实施方案中,所述一种或多种参考凝聚物是细胞凝聚物。在一些实施方案中,所述一种或多种参考凝聚物是体外凝聚物。已经描述了许多细胞凝聚物,并且已知更多的细胞凝聚物已形成,但尚未被描述或命名。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物是细胞质凝聚物。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物是细胞核凝聚物。在一些实施方案中,所述一种或多种细胞凝聚物是裂解体、p颗粒、组蛋白基因座体、多泡体、神经元rna颗粒、核凝胶珠、核孔、核小点、核应激小体、核仁、oct1/ptf/转录(opt)结构域、旁斑、核仁外周区室、pml核体、pml致癌结构域、多梳体、处理体、sam68核体、应激颗粒,或剪接斑点。在一些实施方案中,所述一种或多种细胞凝聚物不是应激颗粒。143.在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物是复数种凝聚物。在一些实施方案中,所述复数种靶凝聚物是细胞组合物的一部分中的一类凝聚物的全部或子集。在一些实施方案中,所述复数种靶凝聚物是细胞组合物中的细胞中的一类凝聚物的全部或子集。在一些实施方案中,所述复数种靶凝聚物是细胞组合物中的细胞的一部分中的一类凝聚物的全部或子集。在一些实施方案中,所述一种或多种参考凝聚物是复数种凝聚物。在一些实施方案中,所述复数种参考凝聚物是细胞组合物的一部分中的一类凝聚物的全部或子集。在一些实施方案中,所述复数种参考凝聚物是细胞组合物中的细胞中的一类凝聚物的全部或子集。在一些实施方案中,所述复数种参考凝聚物是细胞组合物中的细胞的一部分中的一类凝聚物的全部或子集。在一些实施方案中,所述复数种参考凝聚物是体外凝聚物体系中的一类凝聚物的全部或子集。144.在一些实施方案中,所述细胞的所述部分是细胞质、细胞核、细胞器,或非膜结合的隔室。在一些实施方案中,所述的一类凝聚物包括包含特定大分子的凝聚物。在一些实施方案中,所述的一类凝聚物包括作为裂解体的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为p颗粒的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为组蛋白基因座体的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为多泡体的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为神经元rna颗粒的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为核凝胶珠的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为核孔的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为核小点的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为核应激小体的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为核仁的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为oct1/ptf/转录(opt)结构域的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为旁斑的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为核仁外周区室的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为pml核体的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为pml致癌结构域的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为多梳体的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为处理体的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为sam68核体的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为应激颗粒的凝聚物;或所述的一类凝聚物包括作为剪接斑点的凝聚物。145.在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物和所述一种或多种参考凝聚物是相同类别(或类型)的凝聚物。例如,所述一种或多种靶凝聚物和所述一种或多种参考凝聚物可包含一种或多种相同的大分子,可以在相同的条件下形成,可以对刺激具有相同的响应,可以在相同的细胞/组织类型中形成,并且/或者可存在于细胞内的同一位置中。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物和所述一种或多种参考凝聚物包含一种或多种相同的大分子并且存在于细胞内的同一位置中。在一些实施方案中,所述的一类凝聚物包括作为裂解体的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为p颗粒的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为组蛋白基因座体的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为多泡体的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为神经元rna颗粒的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为核凝胶珠的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为核孔的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为核小点的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为核应激小体的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为核仁的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为oct1/ptf/转录(opt)结构域的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为旁斑的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为核仁外周区室的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为pml核体的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为pml致癌结构域的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为多梳体的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为处理体的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为sam68核体的凝聚物;所述的一类凝聚物包括作为应激颗粒的凝聚物;或所述的一类凝聚物包括作为剪接斑点的凝聚物。146.在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物和所述一种或多种参考凝聚物是不同类别(或类型)的凝聚物。例如,所述一种或多种靶凝聚物和所述一种或多种参考凝聚物可包含一种或多种不同的大分子,可以在不同条件下形成,可以对刺激具有不同的响应,可以在不同的细胞/组织类型中形成,可具有本文所述的一种或多种不同特征(例如,形状、流动性、大小、组成等),并且/或者可存在于细胞内的不同位置中。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物和所述一种或多种参考凝聚物包含一种或多种相同的大分子并且存在于细胞内的不同位置中。在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物和所述一种或多种参考凝聚物包含一种或多种相同的大分子并且包含一种或多种不同的大分子。在一些实施方案中,所述不同的大分子是变体。例如,在一些实施方案中,一种大分子是野生型蛋白质,而另一种大分子是突变蛋白质。在一些实施方案中,一种大分子是成熟形式,而另一种大分子是早熟形式。在一些实施方案中,一种大分子不具有翻译后修饰,而另一种大分子具有翻译后修饰。147.各种凝聚物的失调可能与疾病相关联。例如,基于细胞和无细胞凝聚物实验,肉瘤融合蛋白(protein fused in sarcoma,fus)中的疾病相关突变已被证明会导致异常的相分离行为,所述异常的相分离行为会直接导致运动神经元疾病、肌萎缩性侧索硬化症(amyotrophic lateral sclerosis,als)的发展(naumann等人,2018,nat commun,9(1):335).因此,在一些实施方案中,一种或多种靶凝聚物的失调与疾病相关联。在一些实施方案中,所述疾病是神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫性疾病、心脏疾病或代谢疾病。在一些实施方案中,失调包括以下中的一者或多者的改变:一种或多种靶凝聚物的量;一种或多种靶凝聚物的组成;一种或多种靶凝聚物的位置;一种或多种靶凝聚物的分布;一种或多种靶凝聚物的大小;一种或多种靶凝聚物的流动性或凝固;一种或多种靶凝聚物的溶解;一种或多种靶凝聚物的形状;一种或多种靶凝聚物的一种或多种组分的浓度;一种或多种靶凝聚物的一种或多种组分的分布;一种或多种靶凝聚物的一种或多种组分的扩散系数;一种或多种靶凝聚物的一种或多种组分的翻译后修饰;以及一种或多种靶凝聚物内一种或多种组分(例如位于凝聚物的核心中而不是壳中的组分)的异质分布。在一些实施方案中,将所述改变与类似的非失调的凝聚物进行比较。148.在一些实施方案中,所述一种或多种靶凝聚物是复数种凝聚物。在一些实施方案中,所述化合物不导致以下中的一者或多者发生可测量地改变:复数种靶凝聚物的总数目、复数种靶凝聚物的大小、复数种靶凝聚物的形状、复数种靶凝聚物的流动性或凝固、复数种靶凝聚物的位置、复数种靶凝聚物的表面积、复数种靶凝聚物的溶解、复数种靶凝聚物的一种或多种组分的翻译后修饰,以及复数种靶凝聚物内的一种或多种组分的异质分布。149.在一些实施方案中,所述一种或多种靶或参考凝聚物是单一凝聚物,例如单一凝聚物类型。在一些实施方案中,所述化合物不导致选自以下的一种或多种特征发生可测量地改变:靶和/或参考凝聚物的数目、靶和/或参考凝聚物的大小、靶和/或参考凝聚物的位置、靶和/或参考凝聚物的分布、靶和/或参考凝聚物的表面积、靶和/或参考凝聚物的溶解、靶和/或参考凝聚物的形状、靶和/或参考凝聚物的流动性或凝固、靶和/或参考凝聚物的一种或多种组分的翻译后修饰,以及靶和/或参考凝聚物内的一种或多种组分的异质分布。在一些实施方案中,所述一种或多种靶或参考凝聚物是复数种凝聚物,例如复数种凝聚物类型。在一些实施方案中,所述化合物不导致选自以下的一种或多种特征发生可测量地改变:复数种靶和/或参考凝聚物的数目、复数种靶和/或参考凝聚物的大小、复数种靶和/或参考凝聚物的位置、复数种靶和/或参考凝聚物的分布、复数种靶和/或参考凝聚物的表面积、复数种靶和/或参考凝聚物的溶解、复数种靶和/或参考凝聚物的形状、复数种靶和/或参考凝聚物的流动相或凝固、复数种靶和/或参考凝聚物的一种或多种组分的翻译后修饰,以及复数种靶和/或参考凝聚物内的一种或多种组分的异质分布。150.在一些实施方案中,一种或多种凝聚物(诸如一种或多种靶凝聚物、一种或多种参考凝聚物、第一组的一种或多种靶凝聚物、第二组的一种或多种靶凝聚物)的位置在细胞的任何部分,诸如细胞的细胞溶胶或细胞核的任何方面中。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的位置在细胞器或细胞质的粒子中,或基于与其的关联。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的位置描述了一种或多种凝聚物与另一种细胞特征(诸如细胞核或质心)的关联。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的位置是相对于另一种细胞特征(诸如细胞核或质心)。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的位置基于与另一种细胞特征(诸如细胞核或质心)的距离。151.在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的数目是细胞或细胞的一部分中的凝聚物的总数目。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的数目是细胞部分(诸如细胞质或细胞核)中的凝聚物的总数目。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的数目是基于小于总细胞质(或细胞核)的测量值对细胞质(或细胞核)中的凝聚物总数目的估计。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的数目是细胞质的一部分中(诸如视野中或细胞特征中/与细胞特征相关联)的凝聚物的数目。在一些实施方案中,一种或多种靶凝聚物的数量由一种或多种靶凝聚物的总数目与一种或多种参考凝聚物的总数目之比来反映。在一些实施方案中,一种或多种靶凝聚物与一种或多种参考凝聚物的数目之比是不包含第一大分子的一种或多种靶凝聚物与一种或多种参考凝聚物的数目之比。在一些实施方案中,一种或多种靶凝聚物与一种或多种参考凝聚物的数目之比是细胞质的一部分中的一种或多种靶凝聚物与细胞质的另一部分中的一种或多种参考凝聚物的数目之比。在一些实施方案中,一种或多种靶凝聚物与一种或多种参考凝聚物的数目之比是包含第一大分子并且位于某一位置(例如,细胞核)中的一种或多种靶凝聚物与一种或多种参考凝聚物的数目之比。152.在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的分布是在细胞质的一部分(诸如细胞质的细胞特征或视野)中所述一种或多种凝聚物的分布。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的分布是所述一种或多种凝聚物相对于细胞特征(诸如细胞核、细胞器或细胞质中的粒子)的分布。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的分布是在细胞质的一部分(诸如视野)中所述一种或多种凝聚物相对于所述部分中的位置的分布。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的分布基于每种凝聚物与参考点的距离。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的分布是细胞核的一部分中所述一种或多种凝聚物的分布。所述分布可以是均匀的或不均匀的。153.在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的大小基于一种或多种凝聚物中的每一种凝聚物的最大凝聚物交叉尺寸测量值,诸如直径。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的大小基于一种或多种凝聚物中的每种凝聚物的周长。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的大小基于所述一种或多种凝聚物中的每种凝聚物的横截面积,或其成像表示,诸如来自俯视图。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的大小基于一种或多种凝聚物中的每种凝聚物的体积。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的大小基于一种或多种凝聚物的平均大小。在一些实施方案中,与一种或多种凝聚物相关联的特征基于所述一种或多种凝聚物的大小分布(诸如d5、d10、d90或d95)。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的大小是通过粒度测量技术,诸如动态光散射技术确定的。154.在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的稳定性是在细胞活性存在下或在化合物存在下,一种或多种凝聚物随时间推移的稳定性。在一些实施方案中,稳定性基于一种或多种凝聚物的例如大小、数目、形状或量的维持。155.在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的组分的扩散系数是离开所述一种或多种凝聚物的组分(诸如第一大分子)的扩散系数。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的组分的扩散系数是离开所述一种或多种凝聚物的不是第一大分子的组分(例如,其它蛋白质、核酸,或化合物)的扩散系数。156.在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的溶解或大小减小基于所述一种或多种凝聚物中的每种凝聚物的最大凝聚物交叉尺寸测量值,诸如直径。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的溶解或大小减小基于所述一种或多种凝聚物中的每种凝聚物的周长。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的溶解或大小减小基于所述一种或多种凝聚物的平均大小。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的溶解或大小减小基于所述一种或多种凝聚物的大小分布(诸如d5、d10、d90或d95)。157.在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的表面积是基于所述一种或多种凝聚物中的每种凝聚物的周长的估计表面积。158.在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的球形度基于一种或多种凝聚物中的每种凝聚物与完美球体的相似程度。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的球形度是基于一种或多种凝聚物中的每种凝聚物的横截面图或俯视图的估计球形度。在一些实施方案中,与一种或多种凝聚物相关联的特征是一种或多种rbm20凝聚物中的每一种rbm20凝聚物的形状。在一些实施方案中,与一种或多种凝聚物相关联的特征是一种或多种凝聚物的具有形状类型或满足形状参数的部分。159.在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的流动性和/或凝固基于所述一种或多种凝聚物如何彼此融合,以及/或者所述一种或多种凝聚物中的每种凝聚物的结构、大小、形状、球形度、体积、数目和/或表面积随着时间推移的变化。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的流动性和/或凝固基于纤维形成。160.所述特征在一些实施方案中可以基于以下中的任何一者或多者来确定:例如,对细胞或其部分中(诸如在细胞质或细胞核或其一部分中)的一种或多种凝聚物的评定,对细胞内、细胞外或与细胞相关联的任何其它位置(例如,细胞核或其一部分)中的一种或多种凝聚物和/或大分子的评定,或对另一种大分子(诸如另一种凝聚物组分)的评定。161.在一些实施方案中,确定特征是基于对至少一个细胞或其至少一部分的评定来进行的。在一些实施方案中,评定是对复数种细胞的评定。在一些实施方案中,所述细胞的所述部分是视野,诸如显微镜的视野,或其一部分。在一些实施方案中,所述细胞的所述部分是细胞图像的限定的区域,或其一部分。在一些实施方案中,限定的区域基于一种或多种细胞特征(诸如通过荧光融合蛋白表达、细胞核染料或免疫荧光(if)染色),例如细胞核或细胞膜的边界。在一些实施方案中,限定的区域是任意限定的,诸如手动或通过软件限定的。在一些实施方案中,确定特征是基于重复的评定来进行的。在一些实施方案中,重复的评定基于图像的多于一个部分或多于一个图像。在一些实施方案中,确定特征是基于从图像的两个或更多个部分,两个或更多个图像,或获自至少两个或更多个图像的两个或更多个部分获得的平均值或分布来进行的。162.在一些实施方案中,确定特征是基于成像技术来进行的。在一些实施方案中,成像技术提供数据以评定与一种或多种凝聚物和/或大分子相关联的特征(包括大分子与凝聚物的缔合水平)。在一些实施方案中,成像技术包括获得包含细胞或其部分的组合物的图像。在一些实施方案中,所述图像是二维图像。在一些实施方案中,所述图像是三维图像或其渲染。在一些实施方案中,将成像技术与可用于本文所述的方法的另一方法特征相结合,所述另一方法特征为诸如荧光激活细胞分选(fluorescence activated cell sorting,facs)技术或荧光激活粒子分选(fluorescence activated particle sorting,faps)技术。163.在一些实施方案中,本文所述的方法包括通过成像技术对样品或其一部分(诸如细胞组合物)进行成像。在一些实施方案中,成像技术是荧光成像技术。在一些实施方案中,成像技术包括荧光成像技术。在一些实施方案中,成像技术包括比色和荧光成像技术。在一些实施方案中,荧光成像技术包括评定一个或多个通道处的荧光信号。在一些实施方案中,检测到的光是由于对靶的直接标记,例如将标记物掺入或缀合到化合物或大分子中。在一些实施方案中,检测到的光是由于对靶的间接标记,诸如特异性地结合至大分子的经标记的探针,例如,经标记的抗体或其片段、核染料,或与在细胞凋亡期间暴露在细胞膜的外叶上的磷脂酰丝氨酸(ps)结合的膜联蛋白v萤光素酶。在一些实施方案中,所述标记物包括dendra2、gfp,或mcherry。在一些实施方案中,确定所述特征包括免疫荧光技术。在一些实施方案中,本文所述的方法包括使用直接标记技术和间接标记技术。164.在一些实施方案中,所述方法进一步包括确定细胞的一种或多种细胞特征,诸如除了凝聚物之外和/或大分子之外还有的一种或多种细胞特征(如果存在的话)。本领域的技术人员或普通技术人员将容易地认识到可以以多种方式确定细胞特征。在一些实施方案中,所述方法进一步包括使所述组合物或细胞的至少一部分与染色剂(诸如核染料)接触。在一些实施方案中,染色剂是荧光染色剂。在一些实施方案中,染色剂是组织化学染色剂在一些实施方案中,染色剂是基于免疫的染色剂,诸如用于免疫组织化学或免疫细胞化学技术中的染色剂。在一些实施方案中,染色允许可视化细胞特征(如果存在的话),诸如质膜或细胞膜、细胞质、细胞骨架、细胞核、内质网(粗糙和/或平滑)、核糖体、高尔基体、溶酶体、线粒体、液泡或中心体中的任何一者或多者的至少一部分。在一些实施方案中,本文所述的方法进一步包括使细胞组合物或细胞的至少一部分与固定剂接触。165.在一些实施方案中,所述特征是基于具有一种或多种具有所述特征的靶凝聚物的细胞的数目与不具有一种或多种具有所述特征的靶凝聚物的细胞的数目之比来确定的。在一些实施方案中,所述特征是基于具有一种或多种具有所述特征的靶凝聚物的细胞的数目来确定的。166.在一些实施方案中,所述特征是在一段时间内,例如在两个或更多个时间点时确定的。在一些实施方案中,确定所述特征包括评定所述特征在一段时间内的变化。在一些实施方案中,在凝聚物的寿命期间评定所述特征,诸如缔合水平。例如,如本文所讨论的,凝聚物是动态的并且随时间推移变化,因此在可以准确测量化合物对凝聚物的影响时评定所述特征。在一些实施方案中,在细胞的寿命期间,诸如在有丝分裂期间或不在有丝分裂期间,评定所述特征,诸如缔合水平。167.在一些实施方案中,使用一种或多种测量和/或技术来确定所述特征。在一些实施方案中,使用一种或多种测量和/或技术来确定与一种或多种凝聚物和/或多肽相关联的多于一种特征。168.在一些实施方案中,本文所述的方法包括用于例如可视化、分析,和/或定量大分子和/或其前体的技术。此类技术是本领域普通技术人员熟知的。例如,本文涵盖用于可视化诸如荧光标记的蛋白质的蛋白质(包括那些与细胞体系相容的蛋白质)的显微术技术。本文还涵盖用于分析蛋白质的组成(包括翻译后修饰);定量蛋白质;和研究凝聚物的组成(例如,通过交联ms技术“xl-ms”)的质谱(ms)技术。本文还涵盖用于评定细胞过程的功能测定。本文还涵盖富集和/或分离技术,例如用于分离细胞级分的离心技术或用于分离蛋白质或核酸的基于亲和性的技术。在一些实施方案中,所述技术评定一个或多个细胞中或一个或多个细胞的(一个或多个)限定区域中的特征。在一些实施方案中,所述技术评定一个或多个细胞中或一个或多个细胞的(一个或多个)限定区域中的强度、面积和凝聚物计数中的一者或多者。在一些实施方案中,该技术评定具有或不具有所述特征的细胞的数目。在一些实施方案中,该技术评定具有或不具有所述特征的细胞内的凝聚物的数目。在一些实施方案中,该方法包括使用z评分来评估测定和由此产生的结果。z评分及其用途在本领域中是已知的。参见,例如zhang等人,j biomol screen,1999。169.在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的位置是通过评定细胞的至少一部分(诸如细胞特征,例如,细胞质或细胞核)中或与细胞的一部分相关联的一种或多种凝聚物的存在、不存在或水平来确定的。在一些实施方案中,确定一种或多种凝聚物的位置包括确定细胞特征。170.在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的数目是通过评定细胞(诸如细胞质)中凝聚物的总数目来确定的。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的数目是通过评定细胞(例如,细胞质)的一部分(诸如视野)中凝聚物的数目来确定的。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的数目是通过基于小于细胞总量的测量值,估计细胞(诸如细胞质)或其一部分中凝聚物的总数目来确定的。171.在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的大小是通过评定一种或多种凝聚物中的每种凝聚物的最大凝聚物交叉尺寸测量值(诸如直径)来确定的。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的大小是通过评定一种或多种凝聚物中的每种凝聚物的周长来确定的。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的大小是通过评定所述一种或多种凝聚物中的每种凝聚物的横截面积,或其成像表示,诸如来自俯视图来确定的。在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的大小是通过粒度测量技术,诸如动态光散射技术确定的。172.在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的溶解或大小减小是基于在细胞活性存在下或在化合物存在下,一种或多种凝聚物中的每种凝聚物的结构随时间推移的变化确定的。173.在一些实施方案中,一种或多种凝聚物的表面积是基于使用一种或多种凝聚物中的每种凝聚物的测得参数(例如,周长、最大凝聚物交叉尺寸测量值)估计表面积而确定的。174.在一些实施方案中,所述方法包括使细胞组合物与化合物接触,其中所述细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物,并且所述方法进一步包括使一种或多种靶凝聚物在步骤(a)之前形成。在一些实施方案中,所述方法包括使细胞组合物与化合物接触,其中所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触之后形成的,并且所述方法进一步包括使所述一种或多种靶凝聚物形成。形成凝聚物的方法是已知的。例如,细胞应激可导致应激颗粒的形成。细胞应激的示例包括砷酸盐处理、温度变化或ph变化。因此,在一些实施方案中,使一种或多种靶凝聚物形成包括使细胞组合物与砷酸盐、酸或碱接触或者改变细胞组合物的温度。175.对于需要第一组的一种或多种靶凝聚物和第二组的一种或多种靶凝聚物的方法,可以使用本文所公开的任何靶凝聚物。在一些实施方案中,第一组的一种或多种靶凝聚物和第二组的一种或多种靶凝聚物是不同类别的凝聚物,诸如本文所公开的凝聚物的类别中的任何类别的凝聚物。176.在一些实施方案中,该方法包括分析一个或多个图像以评定凝聚物的特征。在一些实施方案中,分析包括映射(mapping)细胞边界或细胞的一部分(诸如细胞器)的边界。在一些实施方案中,分析包括映射凝聚物的边界。在一些实施方案中,分析图像是通过分析软件完成和/或促进的。在一些实施方案中,诸如在时间过程研究中,比较一个或多个图像。在一些实施方案中,分析包括测量凝聚物、大分子,和/或化合物(例如,与凝聚物和/或大分子共定位的化合物)的信号(例如,荧光融合蛋白的信号、if染色,或发光)强度。在一些实施方案中,分析进一步包括计算所测量的信号,诸如凝聚物边界内的所测量的信号的富集。177.在一些实施方案中,凝聚物组分(诸如第一大分子和第二大分子)的共定位是通过评定凝聚物中或与凝聚物相关联的组分(或化合物)的存在、不存在或水平来确定的。在一些实施方案中,直接或间接地进行评定,诸如测量。在一些实施方案中,凝聚物组分是使用质谱技术诸如apex或xl-ms来评定的。在一些实施方案中,凝聚物组分是使用faps技术来评定的。在一些实施方案中,评定包括使用标记技术,诸如将标记物直接缀合至凝聚物组分或使用免疫标记物,诸如在if技术中使用的免疫标记物。在一些实施方案中,分离和/或富集凝聚物,然后评定凝聚物中或与凝聚物相关联的凝聚物组分的存在、不存在或水平。在一些实施方案中,不分离和/或富集(诸如不从其它细胞组分分离和/或富集)凝聚物,例如,评定在原位发生。在一些实施方案中,在评定之前固定凝聚物或包含所述凝聚物的细胞。在一些实施方案中,不在评定之前固定凝聚物或包含所述凝聚物的细胞。在一些实施方案中,本领域中的已知技术可被用来定量凝聚物中的组分的量,诸如成像、质谱、蛋白质印迹、免疫沉淀(immunoprecipitation,ip)、免疫荧光(if)染色、原位、fish、northern印迹,或qpcr。178.大分子179.在一些实施方案中,大分子,诸如第一大分子、所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子,或参考大分子,是核酸或蛋白质。在一些实施方案中,大分子,诸如第一大分子、所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子,或参考大分子,是蛋白质或蛋白质片段。在一些实施方案中,所述蛋白质或蛋白质片段包含低复杂性结构域或固有无序序列。在一些实施方案中,大分子是转录因子或rna结合蛋白。在一些实施方案中,大分子是核酸,诸如rna或dna。在一些实施方案中,大分子是rna。180.在一些实施方案中,第一大分子是fus或eif3。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子是fus、eif3、g3bp1、fus和g3bp1,或eif3和g3bp1。在一些实施方案中,第一大分子是fus,并且所述至少一种附加大分子是eif3、g3bp1,或eif3和g3bp1。在一些实施方案中,第一大分子是eif3,并且所述至少一种附加大分子是fus、g3bp1,或fus和g3bp1。181.在一些实施方案中,第一大分子包含这样的突变,所述突变导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平与不包含所述突变的相关大分子相比发生改变。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子包含这样的突变,所述突变使得所述至少一种附加大分子中的所述一种或多种附加大分子与一种或多种靶凝聚物的相应缔合水平与不包含所述突变的相关大分子相比发生改变。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子中的每种附加大分子包含这样的突变,所述突变使得所述至少一种附加大分子中的每种附加大分子与一种或多种靶凝聚物的相应缔合水平与不包含所述突变的相关大分子相比发生改变。在一些实施方案中,第一大分子包含这样的突变,所述突变导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平与第一大分子与另一种凝聚物的缔合水平相比发生改变。在一些实施方案中,与不包含所述突变的相关大分子相比,所述第一大分子与一种或多种靶凝聚物不具有改变的缔合(或具有至多约2倍的改变的缔合)。在一些实施方案中,第一大分子包含这样的突变,所述突变导致第二大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平发生改变。在一些实施方案中,第一大分子和第二大分子是不同的。在一些实施方案中,第一大分子包含这样的突变,所述突变使得所述第一大分子与一种或多种靶凝聚物在一种或多种细胞(例如,神经元)或组织类型中的缔合水平与所述第一大分子与一种或多种靶凝聚物在另一种细胞(心肌细胞)或组织细胞中的缔合相比发生改变。在一些实施方案中,所述突变与疾病,诸如神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫性疾病、心脏疾病或代谢疾病相关。182.在一些实施方案中,所述大分子,诸如第一大分子或所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子在疾病或应激状态下异常表达。在一些实施方案中,第一大分子在疾病或应激状态下异常表达。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子在疾病或应激状态下异常表达。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子中的每种附加大分子在疾病状态下异常表达。在一些实施方案中,所述大分子与所述一种或多种靶凝聚物的疾病或应激状态缔合水平相较于所述大分子与所述一种或多种靶凝聚物的正常(例如,健康或非应激)状态缔合水平发生改变。在一些实施方案中,所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的疾病或应激状态缔合水平相较于所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的正常状态缔合水平发生改变。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的疾病或应激状态缔合水平相较于所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的正常状态缔合水平发生改变。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子中的每种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的疾病或应激状态缔合水平相较于所述至少一种附加大分子中的每种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的正常状态缔合水平发生改变。在一些实施方案中,所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的疾病或应激状态缔合水平相较于所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的正常状态缔合水平发生改变(例如,改变了至少约2倍),而所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的疾病或应激状态缔合水平相较于所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的正常状态缔合水平未改变(或改变了小于例如2倍)。183.在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子是2种或更多种、3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种大分子。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子是2种或更多种大分子。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子是3种或更多种大分子。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子是5种或更多种大分子。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子是1-10种大分子,诸如1-3种、2-5种、2-9种、3-8种、4-7种、5-10种,或7-10种大分子。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子是单一大分子。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子是2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9种,或10种大分子。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子是至2种大分子。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子是至3种大分子。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子是至5种大分子。184.在一些实施方案中,所述第一大分子和/或所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子是融合蛋白。在一些实施方案中,所述融合蛋白包含标记物。在一些实施方案中,所述标记物是荧光或发光蛋白。在一些实施方案中,第一大分子是包含第一标记物的第一融合蛋白,并且所述至少一种附加大分子中的一种附加大分子是包含第二标记物的第二融合蛋白。在一些实施方案中,所述至少一种附加大分子是复数种大分子。在一些实施方案中,所述复数种包括包含第一标记物的第一融合蛋白和包含第二标记物的第二融合蛋白。在一些实施方案中,第一大分子是包含第一标记物的第一融合蛋白,并且所述复数种包括包含第二标记物的第二融合蛋白和包含第三标记物的第三融合蛋白。在一些实施方案中,第一标记物和第二标记物是可区分的。在一些实施方案中,第一标记物、第二标记物和第三标记物是可区分的。185.在一些实施方案中,所述第一大分子和/或所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子是用标记物(例如,荧光素)进行标识的。另外或替代地,可以通过使细胞组合物与标记物接触来标记大分子。因此,在一些实施方案中,所述方法进一步包括使细胞组合物与标记物接触。在一些实施方案中,所述方法进一步包括标记所述第一大分子和/或所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子。在一些实施方案中,所述标记包括使细胞组合物与包含标记物的抗体或其抗原缔合片段接触。在一些实施方案中,所述标记物是放射性标记物、比色标记物,或荧光标记物。186.在一些实施方案中,所述方法包括使细胞组合物与固定剂接触。示例性固定剂包括甲醛、戊二醛和多聚甲醛。在一些实施方案中,所述方法包括使细胞组合物与透化剂接触。示例性透化剂包括皂苷化合物、甲醇、丙酮或去污剂,诸如triton x-100。187.鉴定化合物特征的方法188.本文还提供了鉴定化合物特征(诸如部分)的方法,所述化合物特征全部或部分地负责以下特异性中的任何一种或多种特异性:大分子特异性、凝聚物特异性和组织特异性。在一些实施方案中,所述鉴定化合物特征的方法包括根据本文所述的方法评定复数种化合物,然后鉴定所述复数种化合物的子集或全部所含有的化合物特征,其中所述复数种化合物的子集或全部表现出相似的特异性。189.在一些方面中,本文所述的方法用于筛选以测定化合物库。在一些方面中,本文所述的方法用于筛选以测定凝聚物库。在一些方面中,本文所述的方法用于筛选以测定细胞库,诸如疾病模型细胞系。在一些方面中,本文所述的方法用于筛选以测定细胞库,其中所述细胞库包括在大分子中具有不同突变(诸如疾病相关突变)的细胞。在一些实施方案中,本文所述的方法包括评定单个体系中的两种或更多种化合物,诸如包含细胞的组合物。190.在一些方面中,本文所述的方法被格式化以用于任何水平的吞吐量,诸如高吞吐量、中等吞吐量或低吞吐量。191.在一些实施方案中,本文所述的方法进一步包括使用第二基于细胞的测定来评定所鉴定的化合物,诸如在具有相似疾病类型(例如,乳腺癌)但具有不同突变(例如,不同等位基因)的细胞组合物中进行。在一些实施方案中,本文所述的方法进一步包括使用体外测定评定所鉴定的化合物。192.在一些实施方案中,本文所述的方法进一步包括确定细胞或其部分中或一种或多种靶凝聚物中的化合物的量。在一些实施方案中,确定化合物的量包括定量地检测所述化合物。在一些实施方案中,确定化合物的量包括定量地检测所述化合物的标记物。在一些实施方案中,确定化合物的量包括检测所述化合物的活性和计算导致检测到的活性量(例如,导致大分子与一种或多种靶凝聚物解除缔合)所需的所述化合物的量。在一些实施方案中,化合物的量是通过质谱、液相色谱,和/或紫外可见分光光度法确定的。在一些实施方案中,化合物的量是通过荧光显微镜确定的。标准曲线可用于帮助确定化合物的量。193.在一些实施方案中,本文提供了鉴定与优先影响第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平相关联的化合物特征的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平,以及至少一种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平;(c)对复数种化合物执行步骤(a)和(b);以及(d)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力之外还共同具有的特征。本文还提供了鉴定与优先影响第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平相关联的化合物特征的方法,其中所述方法包括执行本文所公开的方法的鉴定优先影响第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的复数种化合物的步骤;以及鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力之外还共同具有的特征。194.本文还提供了鉴定与优先降低第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平相关联的化合物特征的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平,以及至少一种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平;(c)对复数种化合物执行步骤(a)和(b);以及(d)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先降低第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力之外还共同具有的特征。本文还提供了鉴定与优先降低第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平相关联的化合物特征的方法,其中所述方法包括执行本文所公开的方法的鉴定优先降低第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的复数种化合物的步骤;以及鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先降低第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力之外还共同具有的特征。195.本文还提供了鉴定与优先增大第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平相关联的化合物特征的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平,以及至少一种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平;(c)对复数种化合物执行步骤(a)和(b);以及(d)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先增大第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力之外还共同具有的特征。本文还提供了鉴定与优先增大第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平相关联的化合物特征的方法,其中所述方法包括执行本文所公开的方法的鉴定优先增大第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的复数种化合物的步骤;以及鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先增大第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力之外还共同具有的特征。196.本文还提供了鉴定与优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合相关联的化合物特征的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子和至少一种附加大分子是否与所述一种或多种靶凝聚物缔合;(c)对复数种化合物执行步骤(a)和(b);以及(d)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合的能力之外还共同具有的特征。本文还提供了鉴定与优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合相关联的化合物特征的方法,其中所述方法包括执行本文所公开的方法的鉴定优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合的复数种化合物的步骤;以及鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合的能力之外还共同具有的特征。197.本文还提供了鉴定与优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物解除缔合相关联的化合物特征的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子和至少一种附加大分子是否与所述一种或多种靶凝聚物解除缔合;(c)对复数种化合物执行步骤(a)和(b);以及(d)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物解除缔合的能力之外还共同具有的特征。本文还提供了鉴定与优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物解除缔合相关联的化合物特征的方法,其中所述方法包括执行本文所公开的方法的鉴定优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物解除缔合的复数种化合物的步骤;以及鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物解除缔合的能力之外还共同具有的特征。198.在一些实施方案中,本文提供了鉴定与相较于一个或多个其它组的一种或多种凝聚物(例如,第二组的一种或多种凝聚物)优先影响第一大分子与第一组的一种或多种凝聚物的缔合水平相关联的化合物特征的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含第一组的一种或多种凝聚物和一个或多个其它组的一种或多种凝聚物(例如,第二组的一种或多种凝聚物);和/或(ii)所述第一组的一种或多种凝聚物和所述一个或多个其它组的一种或多种凝聚物(例如,第二组的一种或多种凝聚物)是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子与第一组的一种或多种凝聚物的缔合水平以及第一大分子与每一其它组的一种或多种凝聚物(例如,第二组的一种或多种凝聚物)的缔合水平;(c)对复数种化合物执行步骤(a)和(b);以及(d)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响第一大分子与第一组的一种或多种凝聚物的缔合水平的能力之外还共同具有的特征。在一些实施方案中,所述第一(或其它)组的一种或多种凝聚物是相同类型的,例如,都是应激颗粒。在一些实施方案中,所述第一(或其它)组的一种或多种凝聚物共享共同的大分子。在一些实施方案中,所述方法进一步包括确定一种或多种附加大分子与第一组的一种或多种凝聚物的缔合水平,以及所述一种或多种附加大分子与每一其它组的一种或多种凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,所述方法进一步包括确定第一大分子与参考凝聚物的缔合水平,以及/或者一种或多种附加大分子与参考凝聚物的缔合水平。199.在一些实施方案中,本文提供了鉴定与相较于一个或多个其它组的一种或多种细胞/组织类型优先影响第一组的一种或多种细胞/组织类型中第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平相关联的化合物特征的方法,所述方法包括:(a)使第一组的一种或多种包含一种或多种细胞/组织类型的细胞组合物和一个或多个其它组的一种或多种包含一种或多种细胞/组织类型的细胞组合物与化合物接触,其中(i)每种细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使每种细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一组的一种或多种细胞组合物中第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平以及每一其它组的一种或多种细胞组合物中第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平;(c)对复数种化合物执行步骤(a)和(b);以及(d)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响第一组的一种或多种包含一种或多种细胞/组织类型的细胞组合物中第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力之外还共同具有的特征。在一些实施方案中,所述方法进一步包括确定第一组的一种或多种细胞组合物中一种或多种附加大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平,以及每一其它组的一种或多种细胞组合物中所述一种或多种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,所述方法进一步包括确定第一组的一种或多种细胞组合物中第一大分子与参考凝聚物的缔合水平,以及每一其它组的一种或多种细胞组合物中所述第一大分子与参考凝聚物的缔合水平。在一些实施方案中,所述方法进一步包括确定第一组的一种或多种细胞组合物中一种或多种附加大分子与参考凝聚物的缔合水平,以及每一其它组的一种或多种细胞组合物中所述一种或多种附加大分子与参考凝聚物的缔合水平。200.在一些实施方案中,本文所述的方法可进一步鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部在改变以下中的一者或多者方面所共有的一种或多种特征:(i)所述一种或多种靶凝聚物的位置;(ii)所述一种或多种靶凝聚物和/或其组分(例如,第一大分子)的分布;(iii)所述一种或多种靶凝聚物的数目;(iv)所述一种或多种靶凝聚物的大小;(v)所述一种或多种靶凝聚物与参考凝聚物的量之比;(vi)与所述一种或多种靶凝聚物相关联的功能活性;(vii)所述一种或多种靶凝聚物的组成;(viii)所述一种或多种靶凝聚物与生物分子的共定位;(ix)所述一种或多种靶凝聚物的组分(例如,第一大分子)的扩散系数;(x)所述一种或多种靶凝聚物的稳定性;(xi)所述一种或多种靶凝聚物的溶解或大小减小;(xii)所述一种或多种靶凝聚物的表面积;(xiii)所述一种或多种靶凝聚物的球形度;(xiv)所述一种或多种靶凝聚物的流动性;(xv)所述一种或多种靶凝聚物的凝固;(xvi)凝聚物组分(例如,第一大分子)的位置;(xvii)凝聚物组分(例如,第一大分子)或其前体的量;(xviii)生物分子(例如,第一大分子)向所述一种或多种靶凝聚物中的凝聚物分配;(xix)与凝聚物组分(例如,第一大分子)相关联的功能活性;(xx)凝聚物组分(例如,第一大分子)的聚集;(xxi)凝聚物组分(例如,第一大分子)的翻译后修饰状态;和(xxii)凝聚物组分(例如,第一大分子)的降解产物的量。201.设计化合物的方法202.本文还提供了设计具有以下特异性中的一种或多种特异性的化合物的方法:大分子特异性、凝聚物特异性和组织特异性。在一些实施方案中,设计方法包括选择和/或装配一个或多个具有所需特异性的部分。203.在一些实施方案中,设计优先影响第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平,以及至少一种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平;(c)对复数种化合物执行步骤(a)和(b);(d)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力之外还共同具有的特征;以及(e)设计包含所鉴定的特征的化合物,从而设计优先影响第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物。204.本文还提供了设计优先降低第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法,所述方法包括(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平,以及至少一种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平;(c)对复数种化合物执行步骤(a)和(b);(d)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先降低第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力之外还共同具有的特征;以及(e)设计包含所鉴定的特征的化合物,从而设计优先降低第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物。205.本文还提供了设计优先增大第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法,所述方法包括(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平,以及至少一种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平;(c)对复数种化合物执行步骤(a)和(b);(d)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先增大第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力之外还共同具有的特征;以及(e)设计包含所鉴定的特征的化合物,从而设计优先增大第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物。206.本文还提供了设计优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合的化合物的方法,所述方法包括(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子和至少一种附加大分子是否与所述一种或多种靶凝聚物缔合;(c)对复数种化合物执行步骤(a)和(b);(d)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合的能力之外还共同具有的特征;以及(e)设计包含所鉴定的特征的化合物,从而设计优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合的化合物。207.本文还提供了设计优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物解除缔合的化合物的方法,所述方法包括(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子和至少一种附加大分子是否与所述一种或多种靶凝聚物解除缔合;(c)对复数种化合物执行步骤(a)和(b);(d)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物解除缔合的能力之外还共同具有的特征;以及(e)设计包含所鉴定的特征的化合物,从而设计优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物解除缔合的化合物。208.在一些实施方案中,本文提供了鉴定与相较于一个或多个其它组的一种或多种凝聚物(例如,第二组的一种或多种凝聚物)优先影响第一大分子与第一组的一种或多种凝聚物的缔合水平相关联的化合物特征的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含第一组的一种或多种凝聚物和一个或多个其它组的一种或多种凝聚物(例如,第二组的一种或多种凝聚物);并且/或者(ii)所述第一组的一种或多种凝聚物和所述一个或多个其它组的一种或多种凝聚物(例如,第二组的一种或多种凝聚物)是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一大分子与第一组的一种或多种凝聚物的缔合水平以及第一大分子与每一其它组的一种或多种凝聚物(例如,第二组的一种或多种凝聚物)的缔合水平;(c)对复数种化合物执行步骤(a)和(b);(d)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响第一大分子与第一组的一种或多种凝聚物的缔合水平的能力之外还共同具有的特征;以及(e)设计包含所鉴定的特征的化合物,从而设计优先影响第一大分子与第一组的一种或多种凝聚物的缔合水平的化合物。在一些实施方案中,所述第一(或其它)组的一种或多种凝聚物是相同类型的,例如,都是应激颗粒。在一些实施方案中,所述第一(或其它)组的一种或多种凝聚物共享共同的大分子。209.在一些实施方案中,本文提供了鉴定与相较于一个或多个其它组的一种或多种细胞/组织类型优先影响第一组的一种或多种细胞/组织类型中第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平相关联的化合物特征的方法,所述方法包括:(a)使第一组的一种或多种包含一种或多种细胞/组织类型的细胞组合物和一个或多个其它组的一种或多种包含一种或多种细胞/组织类型的细胞组合物与化合物接触,其中(i)每种细胞组合物包含一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使每种细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;(b)确定第一组的一种或多种细胞组合物中第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平以及每一其它组的一种或多种细胞组合物中第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平;(c)对复数种化合物执行步骤(a)和(b);(d)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响第一组的一种或多种包含一种或多种细胞/组织类型的细胞组合物中第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力之外还共同具有的特征;以及(e)设计包含所鉴定的特征的化合物,从而设计优先影响第一组的一种或多种包含一种或多种细胞/组织类型的细胞组合物中第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物。210.在一些实施方案中,本文所述的方法进一步包括鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部在改变以下中的一者或多者方面所共有的一种或多种特征:(i)所述一种或多种靶凝聚物的位置;(ii)所述一种或多种靶凝聚物和/或其组分(例如,第一大分子)的分布;(iii)所述一种或多种靶凝聚物的数目;(iv)所述一种或多种靶凝聚物的大小;(v)所述一种或多种靶凝聚物与参考凝聚物的量之比;(vi)与所述一种或多种靶凝聚物相关联的功能活性;(vii)所述一种或多种靶凝聚物的组成;(viii)所述一种或多种靶凝聚物与生物分子的共定位;(ix)所述一种或多种靶凝聚物的组分(例如,第一大分子)的扩散系数;(x)所述一种或多种靶凝聚物的稳定性;(xi)所述一种或多种靶凝聚物的溶解或大小减小;(xii)所述一种或多种靶凝聚物的表面积;(xiii)所述一种或多种靶凝聚物的球形度;(xiv)所述一种或多种靶凝聚物的流动性;(xv)所述一种或多种靶凝聚物的凝固;(xvi)凝聚物组分(例如,第一大分子)的位置;(xvii)凝聚物组分(例如,第一大分子)或其前体的量;(xviii)生物分子(例如,第一大分子)向所述一种或多种靶凝聚物中的凝聚物分配;(xix)与凝聚物组分(例如,第一大分子)相关联的功能活性;(xx)凝聚物组分(例如,第一大分子)的聚集;(xxi)凝聚物组分(例如,第一大分子)的翻译后修饰状态;和(xxii)凝聚物组分(例如,第一大分子)的降解产物的量。在一些实施方案中,本文所述的方法进一步包括设计进一步包含上文鉴定的特征中的一种或多种特征(除了优先影响大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平之外)的化合物,从而设计不仅优先影响大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平,还可改变上面提到的凝聚物/凝聚物组分特征中的一者或多者的化合物。211.在一些实施方案中,本文所述的方法可被用来基于所实现的大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合的期望改变(和/或一种或多种上面提到的凝聚物/凝聚物组分特征的期望改变)来开发一种或多种规则集。在一些实施方案中,所述一种或多种规则集可以用作使用包括建模、计算机,和/或基于计算的技术在内的途径鉴定和/或设计一种或多种化合物的基础,所述技术为例如生物信息学、化学信息学,和/或基于人工智能(artificial intelligence,ai)的对具有本文所述的一种或多种特征的期望调节的化合物的鉴定。还提供了用于确定和/或应用所述一种或多种规则集的计算机软件。212.本领域的技术人员将认识到,若干实施方案在本技术的公开内容的范围和精神内是可能的。本公开通过以下实施例进一步说明,所述实施例不应解释为将本公开的范围或精神局限于所述实施例中所述的具体程序。213.示例性实施方案214.所提供的实施方案有:215.实施方案1.一种鉴定优先影响第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含所述一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;以及(b)确定所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平以及至少一种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平,其中如果所述化合物导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第一参考水平发生的改变多于所述化合物导致每种附加大分子的所述水平相较于每种附加大分子的参考水平发生的改变,则所述化合物优先影响所述第一大分子的所述水平。216.实施方案2.如实施方案1所述的方法,其中所述化合物不导致每种附加大分子的所述水平与所述每种附加大分子的参考水平相比发生可测量地改变。217.实施方案3.一种鉴定优先增大第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含所述一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;以及(b)确定所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平以及至少一种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平,其中如果所述化合物导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第一参考水平发生的增大多于所述化合物导致每种附加大分子的所述水平相较于每种附加大分子的参考水平发生的增大,则所述化合物优先增大所述第一大分子的所述水平。218.实施方案4.如实施方案3所述的方法,其中所述化合物不导致每种附加大分子的所述水平与所述每种附加大分子的参考水平相比发生可测量地增大。219.实施方案5.一种鉴定优先降低第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含所述一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;以及(b)确定所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平以及至少一种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平,其中如果所述化合物导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平相较于第一参考水平发生的改变多于所述化合物导致每种附加大分子的所述水平相较于每种附加大分子的参考水平发生的降低,则所述化合物优先降低所述第一大分子的所述水平。220.实施方案6.如实施方案5所述的方法,其中所述化合物不导致每种附加大分子的所述水平与所述每种附加大分子的参考水平相比发生可测量地降低。221.实施方案7.如实施方案1-6中任一项所述的方法,其中所述第一参考水平是在不存在所述化合物的情况下确定的所述第一大分子与一种或多种参考凝聚物的缔合水平。222.实施方案8.如实施方案1-7中任一项所述的方法,其中所述每种附加大分子的参考水平是在不存在所述化合物的情况下确定的每种附加大分子与一种或多种参考凝聚物的缔合水平。223.实施方案9.一种鉴定优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合的化合物的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含所述一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;以及(b)确定第一大分子和至少一种附加大分子是否与所述一种或多种靶凝聚物缔合,其中如果出现以下情况,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合:(1)所述化合物导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合;(2)所述化合物不导致每种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合;以及(3)所述第一大分子在不存在所述化合物的情况下将不与所述一种或多种靶凝聚物缔合。224.实施方案10.如实施方案9所述的方法,其中如果(4)所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将不与所述一种或多种靶凝聚物缔合,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。225.实施方案11.如实施方案9所述的方法,其中如果(4)所述至少一种附加大分子中的每种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将不与所述一种或多种靶凝聚物缔合,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。226.实施方案12.一种鉴定优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物解除缔合的化合物的方法,所述方法包括:(a)使细胞组合物与化合物接触,其中(i)所述细胞组合物包含所述一种或多种靶凝聚物;并且/或者(ii)所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触的同时和/或之后形成的;以及(b)确定第一大分子和至少一种附加大分子是否与所述一种或多种靶凝聚物缔合,其中如果出现以下情况,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物解除缔合:(1)所述化合物导致所述第一大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合;(2)所述化合物不导致每种附加大分子不与所述一种或多种靶凝聚物缔合;以及(3)所述第一大分子在不存在所述化合物的情况下将与所述一种或多种靶凝聚物缔合。227.实施方案13.如实施方案12所述的方法,其中如果(4)所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将与所述一种或多种靶凝聚物缔合,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。228.实施方案14.如实施方案12所述的方法,其中如果(4)所述至少一种附加大分子中的每种附加大分子在不存在所述化合物的情况下将与所述一种或多种靶凝聚物缔合,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合。229.实施方案15.如实施方案1-14中任一项所述的方法,其中步骤(a)包括使细胞组合物与化合物接触,其中所述细胞组合物包含所述一种或多种靶凝聚物,并且所述方法进一步包括使所述一种或多种靶凝聚物在步骤(a)之前形成。230.实施方案16.如实施方案1-14中任一项所述的方法,其中步骤(a)包括使细胞组合物与化合物接触,其中所述一种或多种靶凝聚物是在使所述细胞组合物与所述化合物接触之后形成的,并且所述方法进一步包括使所述一种或多种靶凝聚物形成。231.实施方案17.如实施方案1-16中任一项所述的方法,其中所述至少一种附加大分子是2种或更多种、3种或更多种、4种或更多种,或5种或更多种大分子。232.实施方案18.如实施方案1-16中任一项所述的方法,其中所述至少一种附加大分子是1-10种大分子。233.实施方案19.如实施方案1-18中任一项所述的方法,其中所述第一大分子在疾病状态下异常表达。234.实施方案20.如实施方案1-19中任一项所述的方法,其中所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的疾病状态缔合水平相较于所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的正常状态缔合水平发生改变。235.实施方案21.如实施方案1-20中任一项所述的方法,其中所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子在疾病状态下异常表达。236.实施方案22.如实施方案1-21中任一项所述的方法,其中所述第一大分子是dna或rna。237.实施方案23.如实施方案1-22中任一项所述的方法,其中所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子是dna或rna。238.实施方案24.如实施方案1-21或23中任一项所述的方法,其中所述第一大分子是蛋白质。239.实施方案25.如实施方案24所述的方法,其中所述第一大分子包含这样的突变,所述突变导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平与不包含所述突变的相关蛋白质相比发生改变。240.实施方案26.如实施方案24或25所述的方法,其中所述第一大分子是fus或eif3。241.实施方案27.如实施方案1-26中任一项所述的方法,其中所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子是蛋白质。242.实施方案28.如实施方案1-27中任一项所述的方法,其中所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子包含这样的突变,所述突变导致所述至少一种附加大分子中的所述一种或多种附加大分子与所述一种或多种靶凝聚物的相应缔合水平与不包含所述突变的相关蛋白质相比发生改变。243.实施方案29.如实施方案1-28中任一项所述的方法,其中所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子是fus、eif3、g3bp1、fus和g3bp1,或eif3和g3bp1。244.实施方案30.如实施方案24-29中任一项所述的方法,其中所述第一大分子和/或所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子是融合蛋白。245.实施方案31.如实施方案1-30中任一项所述的方法,其中所述第一大分子和/或所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子包含标记物。246.实施方案32.如实施方案1-31中任一项所述的方法,所述方法进一步包括标记所述第一大分子和/或所述至少一种附加大分子中的一种或多种附加大分子。247.实施方案33.如实施方案32所述的方法,其中所述标记包括使所述细胞组合物与包含标记物的抗体或其抗原结合片段接触。248.实施方案34.如实施方案31-33中任一项所述的方法,其中所述标记物是放射性标记物、比色标记物,或荧光标记物。249.实施方案35.如实施方案1-34中任一项所述的方法,其中所述细胞组合物包含微生物或动物细胞。250.实施方案36.如实施方案35所述的方法,其中所述细胞组合物包含动物细胞。251.实施方案37.如实施方案36所述的方法,其中所述动物细胞具有神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫性疾病、心脏疾病或代谢疾病的一种或多种特征。252.实施方案38.如实施方案35-37中任一项所述的方法,其中所述动物细胞是hela细胞、hek293细胞、诱导多能干细胞(ipsc细胞)、心肌细胞、肌细胞、干细胞衍生细胞、神经元、癌细胞、免疫细胞,或脂肪细胞。253.实施方案39.如实施方案1-38中任一项所述的方法,其中所述一种或多种靶凝聚物是细胞凝聚物。254.实施方案40.如实施方案1-39中任一项所述的方法,其中所述一种或多种靶凝聚物是细胞核凝聚物或细胞质凝聚物。255.实施方案41.如实施方案39所述的方法,其中所述细胞凝聚物是裂解体、p颗粒、组蛋白基因座体、多泡体、神经元rna颗粒、核凝胶珠、核孔、核小点、核应激小体、核仁、oct1/ptf/转录(opt)结构域、旁斑、核仁外周区室、pml核体、pml致癌结构域、多梳体、处理体、sam68核体、应激颗粒,或剪接斑点。256.实施方案42.如实施方案1-41中任一项所述的方法,其中所述一种或多种靶凝聚物是单一靶凝聚物。257.实施方案43.如实施方案42所述的方法,其中所述化合物不导致以下中的一者或多者发生可测量地改变:所述靶凝聚物的大小、所述靶凝聚物的位置、所述靶凝聚物的表面积,和所述靶凝聚物的溶解。258.实施方案44.如实施方案1-41中任一项所述的方法,其中所述一种或多种靶凝聚物是复数种靶凝聚物。259.实施方案45.如实施方案44所述的方法,其中所述复数种靶凝聚物是所述细胞组合物的一部分中的一类凝聚物的全部或子集。260.实施方案46.如实施方案44或45所述的方法,其中所述复数种靶凝聚物是所述细胞组合物中的细胞中的一类凝聚物的全部或子集。261.实施方案47.如实施方案44-46中任一项所述的方法,其中所述复数种靶凝聚物是所述细胞组合物中的细胞的一部分中的一类凝聚物的全部或子集。262.实施方案48.如实施方案47所述的方法,其中所述细胞的所述部分是细胞质、细胞核,或细胞器。263.实施方案49.如实施方案45-48中任一项所述的方法,其中所述的一类凝聚物包括包含特定大分子的凝聚物。264.实施方案50.如实施方案45-49中任一项所述的方法,其中所述的一类凝聚物包括作为裂解体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为p颗粒的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为组蛋白基因座体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为多泡体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为神经元rna颗粒的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核凝胶珠的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核孔的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核小点的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核应激小体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核仁的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为oct1/ptf/转录(opt)结构域的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为旁斑的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核仁外周区室的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为pml核体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为pml致癌结构域的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为多梳体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为处理体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为sam68核体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为应激颗粒的凝聚物;或其中所述的一类凝聚物包括作为剪接斑点的凝聚物。265.实施方案51.如实施方案44-50中任一项所述的方法,其中所述化合物不导致以下中的一者或多者发生可测量地改变:所述复数种靶凝聚物的总数目;所述复数种靶凝聚物的大小、所述复数种靶凝聚物的位置、所述复数种靶凝聚物的表面积,和所述复数种靶凝聚物的溶解。266.实施方案52.一种鉴定优先影响、降低或增大第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平,或优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的复数种化合物的方法,所述方法包括用复数种化合物执行如实施方案1-51中任一项所述的方法。267.实施方案53.如实施方案52所述的方法,所述方法进一步包括鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响、降低或增大所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力,或者优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的能力之外还共同具有的特征。268.实施方案54.如实施方案53所述的方法,所述方法进一步包括对一种或多种包含所鉴定出的特征的附加测试化合物执行如实施方案1-51中任一项所述的方法。269.实施方案55.如实施方案53或54所述的方法,所述方法进一步包括对一种或多种不包含所鉴定出的特征的附加测试化合物执行如实施方案1-51中任一项所述的方法。270.实施方案56.一种鉴定与优先影响、降低或增大第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平相关联或者与优先导致所述第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合相关联的化合物特征的方法,所述方法包括:(a)执行如实施方案52所述的方法;以及(b)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响、降低或增大所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力,或者优先导致所述第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的能力之外还共同具有的特征。271.实施方案57.一种设计优先影响、降低或增大第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平,或者优先导致所述第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的化合物的方法,所述方法包括:(a)执行如实施方案52所述的方法;(b)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响、降低或增大第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力,或者优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的能力之外还共同具有的特征;以及(c)设计包含所鉴定出的特征的化合物,从而设计优先影响、降低或增大第一大分子与一种或多种靶凝聚物的缔合水平,或者优先导致第一大分子与一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的化合物。272.实施方案58.一种鉴定可用于治疗有需要的个体的疾病的化合物的方法,所述方法包括:执行如实施方案1-51中任一项所述的方法,其中一种或多种靶凝聚物与所述疾病相关联;以及鉴定优先影响、降低或增大第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物的缔合水平或者优先导致第一大分子与所述一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合从而对治疗所述疾病有用的化合物。273.实施方案59.如实施方案58所述的方法,其中所述疾病是神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫性疾病、心脏疾病或代谢疾病。274.实施方案60.一种鉴定优先影响第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法,所述方法包括:用所述第一组的一种或多种靶凝聚物执行如实施方案1-51中任一项所述的方法;以及用第二组的一种或多种靶凝聚物执行如实施方案1-51中任一项所述的方法,其中如果所述化合物对所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的优先影响多于所述化合物对所述第一大分子与所述第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的优先影响,则所述化合物优先影响所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。275.实施方案61.如实施方案60所述的方法,其中所述化合物不影响所述第一大分子与所述第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。276.实施方案62.一种鉴定优先增大第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法,所述方法包括:用所述第一组的一种或多种靶凝聚物执行如实施方案1-51中任一项所述的方法;以及用第二组的一种或多种靶凝聚物执行如实施方案1-51中任一项所述的方法,其中如果所述化合物对所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的优先增大多于所述化合物对所述第一大分子与所述第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的优先增大,则所述化合物优先增大所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。277.实施方案63.如实施方案62所述的方法,其中所述化合物不增大所述第一大分子与所述第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。278.实施方案64.一种鉴定优先降低第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的化合物的方法,所述方法包括:用所述第一组的一种或多种靶凝聚物执行如实施方案1-51中任一项所述的方法;以及用第二组的一种或多种靶凝聚物执行如实施方案1-51中任一项所述的方法,其中如果所述化合物对所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的优先降低多于所述化合物对所述第一大分子与所述第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的优先降低,则所述化合物优先降低所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。279.实施方案65.如实施方案64所述的方法,其中所述化合物不降低所述第一大分子与所述第二组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平。280.实施方案66.一种鉴定优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物缔合的化合物的方法,所述方法包括:用所述第一组的一种或多种靶凝聚物执行如实施方案1-51中任一项所述的方法;以及用第二组的一种或多种靶凝聚物执行如实施方案1-51中任一项所述的方法,其中如果所述化合物优先导致所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物缔合的程度多于所述化合物优先导致所述第一大分子与所述第二组的一种或多种靶凝聚物缔合的程度,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物缔合。281.实施方案67.一种鉴定优先导致第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物解除缔合的化合物的方法,所述方法包括:用所述第一组的一种或多种靶凝聚物执行如实施方案1-51中任一项所述的方法;以及用第二组的一种或多种靶凝聚物执行如实施方案1-51中任一项所述的方法,其中如果所述化合物优先导致所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物缔合的程度多于所述化合物优先导致所述第一大分子与所述第二组的一种或多种靶凝聚物缔合的程度,则所述化合物优先导致所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物解除缔合。282.实施方案68.如实施方案60-67中任一项所述的方法,其中所述第一组和/或第二组的一种或多种靶凝聚物是细胞凝聚物。283.实施方案69.如实施方案60-68中任一项所述的方法,其中所述第一组和/或第二组的一种或多种靶凝聚物是细胞核凝聚物或细胞质凝聚物。284.实施方案70.如实施方案60-68中任一项所述的方法,其中所述第一和/或第二组的一种或多种靶凝聚物是裂解体、p颗粒、组蛋白基因座体、多泡体、神经元rna颗粒、核凝胶珠、核孔、核小点、核应激小体、核仁、oct1/ptf/转录(opt)结构域、旁斑、核仁外周区室、pml核体、pml致癌结构域、多梳体、处理体、sam68核体、应激颗粒,或剪接斑点。285.实施方案71.如实施方案60-70中任一项所述的方法,其中所述第一组和/或第二组的一种或多种靶凝聚物是单一靶凝聚物。286.实施方案72.如实施方案60-70中任一项所述的方法,其中所述第一组和/或第二组的一种或多种靶凝聚物是复数种靶凝聚物。287.实施方案73.如实施方案60-70或72所述的方法,其中所述第一和/或第二组的一种或多种靶凝聚物是所述细胞组合物的一部分中的一类凝聚物的全部或子集。288.实施方案74.如实施方案60-70或72-73中任一项所述的方法,其中所述第一和/或第二组的一种或多种靶凝聚物是所述细胞组合物中的细胞中的一类凝聚物的全部或子集。289.实施方案75.如实施方案60-70或72-74中任一项所述的方法,其中所述第一和/或第二组的一种或多种靶凝聚物是所述细胞组合物中的细胞的一部分中的一类凝聚物的全部或子集。290.实施方案76.如实施方案75所述的方法,其中所述细胞的所述部分是细胞质、细胞核,或细胞器。291.实施方案77.如实施方案73-76中任一项所述的方法,其中所述的一类凝聚物包括包含特定大分子的凝聚物。292.实施方案78.如实施方案73-77中任一项所述的方法,其中所述的一类凝聚物包括作为裂解体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为p颗粒的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为组蛋白基因座体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为多泡体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为神经元rna颗粒的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核凝胶珠的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核孔的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核小点的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核应激小体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核仁的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为oct1/ptf/转录(opt)结构域的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为旁斑的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为核仁外周区室的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为pml核体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为pml致癌结构域的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为多梳体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为处理体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为sam68核体的凝聚物;其中所述的一类凝聚物包括作为应激颗粒的凝聚物;或其中所述的一类凝聚物包括作为剪接斑点的凝聚物。293.实施方案79.如实施方案73-78中任一项所述的方法,其中所述第一组的一种或多种靶凝聚物的类别与所述第二组的一种或多种靶凝聚物的类别相同。294.实施方案80.如实施方案73-78中任一项所述的方法,其中所述第一组的一种或多种靶凝聚物的类别与所述第二组的一种或多种靶凝聚物的类别不同。295.实施方案81.如实施方案60-80中任一项所述的方法,其中所述第一组的一种或多种靶凝聚物与所述第二组的一种或多种靶凝聚物在同一细胞组合物中。296.实施方案82.如实施方案60-81中任一项所述的方法,其中所述细胞组合物包含细胞,所述细胞包含所述第一组的一种或多种靶凝聚物和所述第二组的一种或多种靶凝聚物。297.实施方案83.如实施方案60-80中任一项所述的方法,其中所述第一组的一种或多种靶凝聚物在第一细胞组合物中,而所述第二组的一种或多种靶凝聚物在第二细胞组合物中。298.实施方案84.如实施方案60-83中任一项所述的方法,其中所述第一组的一种或多种靶凝聚物在所述细胞组合物中的细胞中,并且所述细胞具有疾病的一种或多种特征。299.实施方案85.如实施方案84所述的方法,其中所述疾病是神经退行性疾病、增殖性疾病、免疫性疾病、心脏疾病或代谢疾病。300.实施方案86.一种鉴定优先影响、降低或增大第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平,或优先导致所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的复数种化合物的方法,所述方法包括用复数种化合物执行如实施方案60-85中任一项所述的方法。301.实施方案87.如实施方案86所述的方法,所述方法进一步包括鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响、降低或增大所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力,或者优先导致所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的能力之外还共同具有的特征。302.实施方案88.如实施方案87所述的方法,所述方法进一步包括对一种或多种包含所鉴定出的特征的附加测试化合物执行如实施方案60-85中任一项所述的方法。303.实施方案89.如实施方案87或88所述的方法,所述方法进一步包括对一种或多种不包含所鉴定出的特征的附加测试化合物执行如实施方案60-85中任一项所述的方法。304.实施方案90.一种鉴定与优先影响、降低或增大第一大分子与第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平相关联或者与优先导致所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合相关联的化合物特征的方法,所述方法包括:(a)执行如实施方案86所述的方法;以及(b)鉴定所鉴定出的化合物的子集或全部除了具有优先影响、降低或增大所述第一大分子与所述第一组的一种或多种靶凝聚物的缔合水平的能力,或者优先导致所述第一大分子与所述第一组的所述一种或多种靶凝聚物缔合或解除缔合的能力之外还共同具有的特征。305.实施方案91.一种设计优先影响、降低或增大第一大分子与第一组的一种或多种technologies;alexa 594和647)来使细胞中的fus、eif3和g3bp1蛋白可视化。315.使用旋转圆盘共聚焦显微镜利用405/488/561/640nm处的共聚焦荧光获取样品的图像。使用40倍空气物镜捕捉所述图像。将增益设置为1.4并将分箱设置为1。将暴露时间调整为特定于每个标记物的荧光发射强度。暴露时间在100-300ms范围内。使用适当的过滤器设置,从而匹配标记物的激发和发射光谱。图像采集是自动化的,并使用knime(berthold等人,2008,data analysis,machine learning and applications.studies in classification,data analysis,and knowledge organization.springer,berlin,heidelberg)和cellprofiler(carpenter等人,2006,genome biol 7:r100)分析所得数据。为每张图像提取25个成像参数,包括标志物信号液滴计数、面积、形状等。对于每个成像参数,根据以下公式计算整个板的z'因子:316.z'=1-[3*(sd(pos)+sd(neg))/(avg(pos)-avg(neg))][0317]其中sd(pos)是阳性对照的标准偏差,sd(neg)是阴性对照的标准偏差,avg(pos)是阳性对照的平均值,并且avg(neg)是阴性对照的平均值。[0318]此外,使用下面的公式计算每种测试化合物的z评分:[0319]z=(x-x)/s[0320]其中x是样品的均值,并且s是样品的标准偏差。[0321]如果板z’是至少0.1,并且如果至少两个成像参数的z得分与中值参数值相差≥3.0个标准偏差,则化合物被归类为“命中”。[0322]结果[0323]在不存在所述化合物的情况下,fus、eif3和g3bp1似乎都在应激时测试的所有三种细胞系中共定位到相同的凝聚物中,参见图1至图4,无化合物处理。此外,所述化合物中的许多化合物似乎并未改变fus、eif3和g3bp1的定位或水平。发现了几种似乎完全溶解应激颗粒的化合物,示例性图像在图1和图2中示出,图1和图2中使用的化合物在表1中给出。没有发现从应激颗粒中选择性排除g3bp1的化合物。每当发现在用所述化合物处理后g3bp1未定位到应激颗粒中时,均未发现fus和eif3在处理后被定位到所述应激颗粒中。相比之下,发现至少四种化合物导致fus从应激颗粒中被部分或完全排除,但不降低所测定的任何其它蛋白质的水平或似乎溶解应激颗粒,示例性图像参见图3,图3中使用的化合物在表1中给出。同样与g3bp1相比,发现至少三种化合物导致eif3从应激颗粒中被部分或完全排除,但不降低所测定的任何其他蛋白质的水平或似乎溶解应激颗粒,示例性图像参见图4,图4中使用的化合物在表1中给出。[0324]表1:选择性和非选择性凝聚物破坏物[0325][0326][0327]实施例2[0328]该实施例展示了一种鉴定具有大分子特异性和组织特异性的化合物的方法。[0329]方法[0330]在该实施例中使用的方法类似于在实施例1中讨论的方法。简而言之,让三种细胞系(hela kyoto、包含编码fus-gfp的细菌人工染色体(bac)的hela,和表达fus-gfp的诱导多能干细胞(ips))分别在培养基中生长。将来自化合物库的1200种化合物单独以1μm、5μm或25μm的浓度暴露于所述细胞系中的一种细胞系中达一小时。对于一些化合物,对其它细胞系中的一种或两种细胞系重复此程序。通过0.0021μm、0.0062μm、0.017μm、0.065μm、0.131μm、0.196μm、0.52μm、3.3μm、10μm和30μm的化合物处理进一步表征来自筛选的命中,其中使用四参数逻辑方程分析所得的剂量反应数据,以计算化合物的效力(类似于ic50)。未暴露于化合物(仅dmso媒介物处理)的细胞用作对照。然后使用终浓度为2mm的砷酸钾(sigma a6631,在pbs中稀释),将细胞暴露于砷酸盐应激中达1小时以刺激应激颗粒的形成。[0331]在应激处理后,将细胞用终浓度为3.7%的甲醛(fa)在室温下固定15分钟。随后,将细胞用洗板机洗涤,透化(在室温下使用0.1%triton x/pbs达10分钟)并封闭(使用0.2%的鱼皮明胶/pbs达30分钟)。对于表达fus-gfp的细胞,直接观察到了gfp荧光。对于其它感兴趣的蛋白质标志物,施加抗fus(sigma amab90549;1:500)、抗eif3(santa cruz sc-137214;1:500)和抗g3bp1(invitrogen pa5-29455;1:4000)抗体和适当的二抗(life technologies;alexa 594和647)来使细胞中的fus、eif3和g3bp1蛋白可视化。[0332]使用旋转圆盘共聚焦显微镜利用405/488/561/640nm处的共聚焦荧光获取样品的图像。使用40倍(主筛选)和20倍(效力测试)的空气物镜捕捉图像。将增益设置为1.4并将分箱设置为1。将暴露时间调整为特定于每个标记物的荧光发射强度。暴露时间在100-300ms范围内。使用适当的过滤器设置,从而匹配标记物的激发和发射光谱。图像采集是自动化的,并使用knime(berthold等人,2008,data analysis,machine learning and applications.studies in classification,data analysis,and knowledge organization.springer,berlin,heidelberg)、cellprofiler(carpenter等人,2006,genome biol 7:r100)分析所得数据;或者,对于效力测试,使用harmony(perkinelmer,waltham ma)和vault(collaborative drug discovery,burlingame ca)分析数据。为每张图像提取25个成像参数,包括标志物信号液滴计数、面积、形状等。对于每个成像参数,根据以下公式计算整个板的z'因子:[0333]z'=1-[3*(sd(pos)+sd(neg))/(avg(pos)-avg(neg))][0334]其中sd(pos)是阳性对照的标准偏差,sd(neg)是阴性对照的标准偏差,avg(pos)是阳性对照的平均值,并且avg(neg)是阴性对照的平均值。[0335]此外,使用下面的公式计算每种测试化合物的z评分:[0336]z=(x-x)/s[0337]其中x是样品的均值,并且s是样品的标准偏差。[0338]如果板z’是至少0.1,并且如果至少两个成像参数的z得分与中值参数值相差≥3.0个标准偏差,则化合物被归类为“命中”。[0339]筛选命中的效力计算(类似于抑制浓度50;ic50)是使用每个细胞的细胞质滴数的测量值和用于分析的四参数逻辑方程进行的。简而言之,首先将化合物处理的%效应作为化合物的log10(摩尔浓度)的函数进行绘图。接下来,通过最小二乘最小化将数据与4参数逻辑方程拟合,以计算50%抑制常数(ic50)。[0340]%效应=(测量值-阴性对照)/(阳性对照-阴性对照)*100[0341]逻辑方程:[0342]y=下限+(上限-下限)/(1+10^((logic50-x)*hs))[0343]其中:[0344]x=log10(化合物的摩尔浓度)[0345]下限=剂量反应的下基线[0346]上限=剂量反应的上基线[0347]hs=剂量反应的hill斜率[0348]结果[0349]在不存在所述化合物的情况下,fus、eif3和g3bp1似乎都在应激时测试的所有三种细胞系中共定位到相同的凝聚物中(参见图5至图10,无化合物处理)。如图5至图10所示,所述化合物中的许多化合物似乎没有改变fus、eif3和g3bp1的定位或水平,并且发现某些化合物似乎完全溶解应激颗粒。图5至图10中使用的化合物及其大分子特异性在表2中给出。没有发现从应激颗粒选择性排除g3bp1的化合物。每当发现在用所述化合物处理后g3bp1未定位到应激颗粒中时,均未发现fus和eif3在处理后被定位到所述应激颗粒中。相比之下,发现有化合物导致fus从应激颗粒中被排除,但不降低所测定的任何其它蛋白质的水平或似乎溶解应激颗粒(参见例如,图7)。同样与g3bp1相比,发现至少三种化合物导致eif3从应激颗粒中被部分或完全排除,但不降低所测定的任何其他蛋白质的水平或似乎溶解应激颗粒(参见例如,图8)。发现一种化合物导致eif3和fus都被排除,但没导致g3bp1被排除(参见图9)。还观察到一种化合物在人ipsc细胞中选择性地排除fus,但在hela bac fus-gfp细胞中未能如此(参见图10)。[0350]相对于其它蛋白质排除给定蛋白质的化合物选择性可以通过计算相对于其它蛋白质排除特定蛋白质的效力(类似于抑制常数50%(ic50))来进一步定量。图11含有ym155的示例剂量依赖性曲线和效力值,证明了相对于fus和g3bp1,eif3在较低化合物浓度下被排除。该信息提供了用于鉴定化合物特异性的附加比较手段,例如剂量依赖性曲线和/或效力值。[0351]表2:选择性和非选择性凝聚物破坏物[0352][0353]









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